RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 RILPL2Q969X0 211 aa22.98■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 PPP2R1AP30153 589 aa22.98■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 RIPK4P57078 832 aa22.98■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 KIF16BQ96L93 1317 aa22.97■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 EVC2Q86UK5 1308 aa22.96■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 NUTM2FA1L443 756 aa22.96■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.96■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 BCAR3O75815 825 aa22.96■■□□□ 1.27
PRKCI-201ENST00000295797 PTPRGP23470 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 GPATCH3Q96I76 525 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 TOP2BQ02880 1626 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 SKAP1Q86WV1 359 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 TRAK2O60296 914 aa22.89■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 NCAPD3P42695 1498 aa22.89■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 NAIPQ13075 1403 aa22.89■■□□□ 1.26
PRKCI-201ENST00000295797 MRE11P49959 708 aa22.89■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.89■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 BECN2A8MW95 431 aa22.88■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 TPM3P06753 285 aa22.88■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 KIF3AQ9Y496 699 aa22.88■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.87■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 MCTP1Q6DN14 999 aa22.87■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 REC8O95072 547 aa22.86■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 MTHFSP49914 203 aa22.86■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 NPHP1O15259 732 aa22.86■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF592Q92610 1267 aa22.86■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.85■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 AMPHP49418 695 aa22.85■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 AAMPQ13685 434 aa22.85■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 33.8
PRKCI-201ENST00000295797 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.84■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 PDE3AQ14432 1141 aa22.83■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PRKCI-201ENST00000295797 PRDM2Q13029 1718 aa22.82■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 MAP7D2Q96T17 732 aa22.82■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.82■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 COG3Q96JB2 828 aa22.82■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 GPS2Q13227 327 aa22.81■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 HMOX1P09601 288 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 NUCB2P80303 420 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 CLSTN1O94985 981 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.8■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 H3BQV1 296 aa22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 GORABQ5T7V8 394 aa22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 IFFO2Q5TF58 517 aa22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.78■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.77■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 NECTIN2Q92692 538 aa22.77■■□□□ 1.24
PRKCI-201ENST00000295797 CABP2Q9NPB3 220 aa22.76■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 TEX35Q5T0J7 233 aa22.75■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 STAC3Q96MF2 364 aa22.75■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.75■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 CDC45O75419 566 aa22.74■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 TPM2P07951 284 aa22.74■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.74■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 RNF214Q8ND24 703 aa22.73■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 GNAI1P63096 354 aa22.73■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.72■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 DAPK1P53355 1430 aa22.72■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.71■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.7■■□□□ 1.23
PRKCI-201ENST00000295797 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PRKCI-201ENST00000295797 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.7■■□□□ 1.22
PRKCI-201ENST00000295797 HOMER1Q86YM7 354 aa22.69■■□□□ 1.22
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.69■■□□□ 1.22
PRKCI-201ENST00000295797 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms