RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.14■■■□□ 2.1
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.14■■■□□ 2.1
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 NLRP13Q86W25 1043 aa28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 MADDQ8WXG6 1647 aa28.12■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.12■■■□□ 2.09
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UBE2Q1-201ENST00000292211 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.11■■■□□ 2.09
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UBE2Q1-201ENST00000292211 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 LAMC1P11047 1609 aa28.09■■■□□ 2.09
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.03■■■□□ 2.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF1BO60333 1816 aa28.03■■■□□ 2.08
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UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.01■■■□□ 2.07
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UBE2Q1-201ENST00000292211 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.99■■■□□ 2.07
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UBE2Q1-201ENST00000292211 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.95■■■□□ 2.07
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UBE2Q1-201ENST00000292211 MROH2AA6NES4 1674 aa27.91■■■□□ 2.06
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UBE2Q1-201ENST00000292211 MYOM2P54296 1465 aa27.91■■■□□ 2.06
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UBE2Q1-201ENST00000292211 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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UBE2Q1-201ENST00000292211 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.89■■■□□ 2.05
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC24A1O60721 1099 aa27.87■■■□□ 2.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.87■■■□□ 2.05
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UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
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UBE2Q1-201ENST00000292211 GLI2P10070 1586 aa27.78■■■□□ 2.04
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PIK3C2GO75747 1445 aa27.76■■■□□ 2.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.76■■■□□ 2.03
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UBE2Q1-201ENST00000292211 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.73■■■□□ 2.03
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.73■■■□□ 2.03
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UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.69■■■□□ 2.02
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UBE2Q1-201ENST00000292211 CABP2Q9NPB3 220 aa27.66■■■□□ 2.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MORC1Q86VD1 984 aa27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 POGKQ9P215 609 aa27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 EVC2Q86UK5 1308 aa27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYOM1P52179 1685 aa27.63■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.63■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.62■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.62■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.61■■■□□ 2.01
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