RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.16■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP2R1AP30153 589 aa21.16■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.15■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 MLECQ14165 292 aa21.15■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 CEP152O94986 1710 aa21.14■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.14■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 STK26Q9P289 416 aa21.14■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 IDI1Q13907 227 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.13■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.12■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 PLIN1O60240 522 aa21.12■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 CDCA8Q53HL2 280 aa21.1■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.09■□□□□ 0.97
SLC20A1-201ENST00000272542 STAC3Q96MF2 364 aa21.08■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 MROH2AA6NES4 1674 aa21.07■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCA6Q8N139 1617 aa21.07■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 LAMC1P11047 1609 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 26.1
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.06■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 IQGAP1P46940 1657 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.04■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.03■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 ERVK-7P63135 1459 aa21.03■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.02■□□□□ 0.96
SLC20A1-201ENST00000272542 CABP2Q9NPB3 220 aa21.02■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF1BO60333 1816 aa21.01■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC3O15438 1527 aa21■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.99■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.99■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.98■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 APAF1O14727 1248 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 NEO1Q92859 1461 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 NEUROD2Q15784 382 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.97■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 MYOM2P54296 1465 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 TSPOAP1O95153 1857 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.96■□□□□ 0.95
SLC20A1-201ENST00000272542 SKAP1Q86WV1 359 aa20.95■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 PIK3C2GO75747 1445 aa20.95■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.95■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRB3O60242 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.94■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 MORC1Q86VD1 984 aa20.93■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.93■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.92■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.91■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.9■□□□□ 0.94
SLC20A1-201ENST00000272542 MYOM1P52179 1685 aa20.89■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 PDE3BQ13370 1112 aa20.89■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 SYNMO15061 1565 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 PRAM1Q96QH2 718 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 MSH5O43196 834 aa20.88■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.87■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 POGKQ9P215 609 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 CRBNQ96SW2 442 aa20.86■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 MTHFSP49914 203 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRB1O14514 1584 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 RICTORQ6R327 1708 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 IFT172Q9UG01 1749 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.85■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 FBLN1P23142 703 aa20.84■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA2Q08379 1002 aa20.84■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.84■□□□□ 0.93
SLC20A1-201ENST00000272542 EVC2Q86UK5 1308 aa20.83■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 PPLO60437 1756 aa20.82■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC24A1O60721 1099 aa20.8■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 BCAR3O75815 825 aa20.79■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.78■□□□□ 0.92
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