RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 TOMM22Q9NS69 142 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 GNAI1P63096 354 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 CRBNQ96SW2 442 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 PHF14O94880 888 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 COG6Q9Y2V7 657 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 RILPL2Q969X0 211 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRE-201ENST00000254667 HFM1A2PYH4 1435 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 PLIN1O60240 522 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 AAMPQ13685 434 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 HMGXB3Q12766 1538 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 PDE4AP27815 886 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 ARAP1Q96P48 1450 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 AFAP1Q8N556 730 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 REC8O95072 547 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 ATF3P18847 181 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 SYNJ1O43426 1573 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRE-201ENST00000254667 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 TOPBP1Q92547 1522 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 H3BQV1 296 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 IFFO2Q5TF58 517 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 PRXQ9BXM0 1461 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 TOP2BQ02880 1626 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 CABP2Q9NPB3 220 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 USP35Q9P2H5 1018 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRE-201ENST00000254667 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 MARCH6O60337 910 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 HECW1Q76N89 1606 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 NESP48681 1621 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 NLRP6P59044 892 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 HMOX1P09601 288 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 RNF20Q5VTR2 975 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 NECTIN2Q92692 538 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRE-201ENST00000254667 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 ERC2O15083 957 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 MTHFSP49914 203 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 MSH5O43196 834 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 TRDNQ13061 729 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 TRIM29Q14134 588 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 VPS37DQ86XT2 251 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 PPP2R1AP30153 589 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 VPS53Q5VIR6 699 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRE-201ENST00000254667 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.13■■□□□ 1.29
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