RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Taok2Q6ZQ29 1240 aa12.85□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf608Q56A10 1511 aa12.84□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ttll13A4Q9F6 804 aa12.84□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 LtbrP50284 415 aa12.84□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 VaspP70460 375 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MetrnQ8C1Q4 291 aa12.83□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa12.83□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa12.82□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc24a3Q99PD7 645 aa12.81□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ttc37F8VPK0 1563 aa12.81□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa12.8□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr7Q920I9 1489 aa12.8□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kdm5bQ80Y84 1544 aa12.79□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abca5Q8K448 1642 aa12.79□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cux1P53564 1515 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfyve16Q80U44 1528 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AdgbG3UZ78 1657 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Irf6P97431 467 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kctd12Q6WVG3 327 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fyco1Q8VDC1 1437 aa12.78□□□□□ -0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tsr1Q5SWD9 803 aa12.77□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 A930017K11RikE0CXQ2 571 aa12.76□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atp10dQ8K2X1 1416 aa12.76□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fndc1E9Q043 1732 aa12.76□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgef11Q68FM7 1552 aa12.75□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scaf8Q6DID3 1268 aa12.75□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cep162Q6ZQ06 1403 aa12.75□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itgbl1Q8VDV0 494 aa12.74□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa12.73□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam221bQ8C627 487 aa12.72□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa12.72□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Aebp1Q640N1 1128 aa12.71□□□□□ -0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mre11Q61216 706 aa12.7□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itga6Q61739 1091 aa12.7□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa12.7□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Retreg3Q9CQV4 466 aa12.7□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyb5rlB1AS42 316 aa12.69□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Apba2P98084 750 aa12.69□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif27Q7M6Z4 1394 aa12.69□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 HrcG5E8J6 738 aa12.68□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Aldh16a1Q571I9 802 aa12.68□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adra2bP30545 450 aa12.67□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hs1bp3Q3TC93 395 aa12.67□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arid3aQ62431 601 aa12.67□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mllt3A2AM29 569 aa12.66□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Alpk3Q924C5 1678 aa12.66□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NhsB1AV60 1647 aa12.66□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ncoa2Q61026 1462 aa12.65□□□□□ -0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa12.64□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 A2mQ6GQT1 1474 aa12.64□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AglF8VPN4 1532 aa12.63□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ubap1lG3UW59 384 aa12.63□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm20503G3UZK1 150 aa12.63□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Alkbh8Q80Y20 664 aa12.63□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fancd2Q80V62 1450 aa12.63□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rhox13F6YCR7 232 aa12.62□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Saxo1B1AXP3 476 aa12.61□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam160a1Q505K2 1081 aa12.61□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kcnc4Q8R1C0 628 aa12.61□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rpusd2Q149F1 553 aa12.6□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gpc1Q9QZF2 557 aa12.6□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Setd5Q5XJV7 1441 aa12.6□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Magi1Q6RHR9 1471 aa12.59□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Col9a1Q05722 921 aa12.59□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc27a5Q4LDG0 689 aa12.59□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ak7Q9D2H2 614 aa12.59□□□□□ -0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mroh2aD3Z750 1679 aa12.58□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cul7Q8VE73 1689 aa12.58□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rccd1Q8BTU7 377 aa12.58□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ankrd26Q811D2 1581 aa12.57□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map2k7Q8CE90 535 aa12.57□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa12.57□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BlmO88700 1416 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf17Q99MV7 1640 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prpmp5E9PXN1 296 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Clcn1Q64347 994 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Clec2iQ9WVF9 217 aa12.56□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arap1Q4LDD4 1452 aa12.55□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lmod2Q3UHZ5 550 aa12.55□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gcc2Q8CHG3 1679 aa12.54□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pxylp1Q8BHA9 480 aa12.54□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa12.53□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ncoa3O09000 1398 aa12.53□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Naip2Q9QUK4 1447 aa12.53□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prex2Q3LAC4 1598 aa12.52□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abca8bQ8K440 1620 aa12.52□□□□□ -0.4
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rgs9O54828 675 aa12.52□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NntQ61941 1086 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ufsp1Q9CZP0 217 aa12.5□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lemd3Q9WU40 921 aa12.5□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms