RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chic1Q8CBW7 227 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29.51■■■□□ 2.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phf23Q8BSN5 401 aa26.71■■□□□ 1.87
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gab3Q8BSM5 595 aa25.49■■□□□ 1.67
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plppr3Q7TPB0 716 aa25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kcna4Q61423 654 aa22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam163aQ8CAA5 168 aa22.08■■□□□ 1.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hoxd11P23813 323 aa21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trap1aP19473 224 aa21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf219Q6IQX8 726 aa20.89■□□□□ 0.93
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chrna2Q91X60 512 aa20.44■□□□□ 0.86
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dmrt2Q8BG36 561 aa20.41■□□□□ 0.86
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ArsiQ32KI9 573 aa20.33■□□□□ 0.85
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rsph4aQ8BYM7 716 aa20.31■□□□□ 0.84
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rimbp2Q80U40 1072 aa20.03■□□□□ 0.8
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19.93■□□□□ 0.78
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Akt1s1Q9D1F4 257 aa19.78■□□□□ 0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.64■□□□□ 0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atf5O70191 283 aa19.51■□□□□ 0.71
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc34a2Q9DBP0 697 aa19.5■□□□□ 0.71
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc4a1apE9PX68 744 aa19.38■□□□□ 0.69
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa19.38■□□□□ 0.69
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hs6st3Q9QYK4 470 aa19.38■□□□□ 0.69
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GapdhsQ64467 440 aa19.15■□□□□ 0.66
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bach1P97302 739 aa18.82■□□□□ 0.6
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sox12Q04890 314 aa18.79■□□□□ 0.6
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa18.69■□□□□ 0.58
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 WdpcpQ8C456 722 aa18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf704Q9ERQ3 566 aa18.23■□□□□ 0.51
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa18.16■□□□□ 0.5
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Egfem1Q8C088 590 aa17.92■□□□□ 0.46
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa17.88■□□□□ 0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa17.8■□□□□ 0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 G430095P16RikE9Q913 147 aa17.77■□□□□ 0.44
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa17.71■□□□□ 0.43
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NischQ80TM9 1593 aa17.61■□□□□ 0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdca7Q9D0M2 382 aa17.59■□□□□ 0.41
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf216P58283 853 aa17.51■□□□□ 0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb12Q9Z150 459 aa17.47■□□□□ 0.39
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nlrp6Q91WS2 869 aa17.45■□□□□ 0.38
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam71e1A1L3C1 212 aa17.35■□□□□ 0.37
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ms4a5Q810P8 197 aa17.3■□□□□ 0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa17.29■□□□□ 0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trim41Q5NCC3 630 aa17.25■□□□□ 0.35
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nkx1-1G3UXB3 402 aa17.2■□□□□ 0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Npm2Q80W85 207 aa17.17■□□□□ 0.34
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc9P70170 1546 aa17.07■□□□□ 0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MyclP10166 368 aa17.07■□□□□ 0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc8B2RUS7 1588 aa17.05■□□□□ 0.32
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf703P0CL69 594 aa17■□□□□ 0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AcrbpQ3V140 540 aa16.98■□□□□ 0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa16.96■□□□□ 0.31
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ildr2B5TVM2 661 aa16.94■□□□□ 0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kcnn1Q9EQR3 537 aa16.94■□□□□ 0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pde4cQ3UEI1 686 aa16.92■□□□□ 0.3
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prr29B1ARI9 187 aa16.86■□□□□ 0.29
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prm3Q62100 101 aa16.79■□□□□ 0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbln2P37889 1221 aa16.78■□□□□ 0.28
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Styxl1Q9DAR2 321 aa16.59■□□□□ 0.25
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pitpnm1O35954 1243 aa16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Clcn6O35454 870 aa16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ScribQ80U72 1612 aa16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MpndQ3TV65 487 aa16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pip4p2Q9CZX7 257 aa16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kank3Q9Z1P7 791 aa16.47■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Skida1Q80YR3 822 aa16.46■□□□□ 0.23
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trim35Q8C006 501 aa16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tshz2Q68FE9 1030 aa16.34■□□□□ 0.21
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ube2uB1AUC4 352 aa16.3■□□□□ 0.2
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cadps2Q8BYR5 1297 aa16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NacadQ5SWP3 1504 aa16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kdm5dQ62240 1548 aa15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nyap1Q6PFX7 833 aa15.98■□□□□ 0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa15.96■□□□□ 0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrrc43Q3V0L5 667 aa15.95■□□□□ 0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tcf3P15806 651 aa15.93■□□□□ 0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Jarid2Q62315 1234 aa15.9■□□□□ 0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dok7Q18PE0 504 aa15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SnphQ80U23 495 aa15.76■□□□□ 0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sycp2Q9CUU3 1500 aa15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sra1Q80VJ2 232 aa15.55■□□□□ 0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dcaf1Q80TR8 1506 aa15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ArntlQ9WTL8 632 aa15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BicraF8VPZ9 1578 aa15.49■□□□□ 0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rhox8Q6VSS7 320 aa15.34■□□□□ 0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa15.32■□□□□ 0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MycnP03966 462 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gjc2Q8BQU6 440 aa15.3■□□□□ 0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa15.25■□□□□ 0.03
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zranb1Q7M760 708 aa15.24■□□□□ 0.03
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ecm2Q5FW85 670 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.1 ms