Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
Rpusd2Q149F1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rpusd2Q149F1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rpusd2Q149F1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Rpusd2Q149F1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Rpusd2Q149F1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rpusd2Q149F1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Rpusd2Q149F1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rpusd2Q149F1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rpusd2Q149F1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rpusd2Q149F1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rpusd2Q149F1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rpusd2Q149F1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Rpusd2Q149F1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rpusd2Q149F1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rpusd2Q149F1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rpusd2Q149F1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Rpusd2Q149F1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rpusd2Q149F1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rpusd2Q149F1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rpusd2Q149F1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Rpusd2Q149F1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rpusd2Q149F1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpusd2Q149F1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rpusd2Q149F1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rpusd2Q149F1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rpusd2Q149F1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rpusd2Q149F1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Rpusd2Q149F1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rpusd2Q149F1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Rpusd2Q149F1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rpusd2Q149F1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rpusd2Q149F1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rpusd2Q149F1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rpusd2Q149F1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rpusd2Q149F1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rpusd2Q149F1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpusd2Q149F1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rpusd2Q149F1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rpusd2Q149F1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rpusd2Q149F1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rpusd2Q149F1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rpusd2Q149F1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rpusd2Q149F1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Rpusd2Q149F1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpusd2Q149F1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rpusd2Q149F1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rpusd2Q149F1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rpusd2Q149F1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rpusd2Q149F1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rpusd2Q149F1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rpusd2Q149F1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpusd2Q149F1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpusd2Q149F1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rpusd2Q149F1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rpusd2Q149F1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rpusd2Q149F1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rpusd2Q149F1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rpusd2Q149F1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpusd2Q149F1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpusd2Q149F1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpusd2Q149F1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpusd2Q149F1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpusd2Q149F1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rpusd2Q149F1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rpusd2Q149F1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpusd2Q149F1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpusd2Q149F1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpusd2Q149F1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpusd2Q149F1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpusd2Q149F1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rpusd2Q149F1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rpusd2Q149F1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rpusd2Q149F1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rpusd2Q149F1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Rpusd2Q149F1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rpusd2Q149F1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpusd2Q149F1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpusd2Q149F1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpusd2Q149F1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpusd2Q149F1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpusd2Q149F1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rpusd2Q149F1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rpusd2Q149F1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rpusd2Q149F1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rpusd2Q149F1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpusd2Q149F1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rpusd2Q149F1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpusd2Q149F1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
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