RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rwdd1Q9CQK7 243 aa26.35■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 PrxO55103 1391 aa26.34■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Atp10dQ8K2X1 1416 aa26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif3bQ61771 747 aa26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Stk24Q99KH8 431 aa26.33■■□□□ 1.81
Smad4-201ENSMUST00000025393 Slc4a1apE9PX68 744 aa26.32■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mre11Q61216 706 aa26.3■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc1O35379 1528 aa26.29■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ak7Q9D2H2 614 aa26.29■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Trim26Q99PN3 545 aa26.29■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 AI481877A2ALV5 1481 aa26.28■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa26.27■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nlrp6Q91WS2 869 aa26.27■■□□□ 1.8
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa26.26■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Zscan10Q3URR7 782 aa26.26■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Srcin1Q9QWI6 1250 aa26.26■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.24■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rnf17Q99MV7 1640 aa26.24■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Prdm16A2A935 1275 aa26.22■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm5cP41230 1554 aa26.21■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adamts13Q769J6 1426 aa26.2■■□□□ 1.79
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gm20521D3Z5F7 333 aa26.2■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ipo8Q7TMY7 1010 aa26.19■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tmf1B9EKI3 1091 aa26.19■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cnga1P29974 684 aa26.17■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.17■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fan1Q69ZT1 1020 aa26.17■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 AU015836B2RUM3 263 aa26.16■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tspyl2Q7TQI8 677 aa26.16■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 NhsB1AV60 1647 aa26.15■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cfap74Q3UY96 1578 aa26.14■■□□□ 1.78
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.14■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Chd1P40201 1711 aa26.13■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc3B2RX12 1523 aa26.12■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Vsig10D3YX43 558 aa26.11■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tulp4Q9JIL5 1547 aa26.1■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa26.1■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fam184bQ0KK56 942 aa26.09■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Lemd3Q9WU40 921 aa26.08■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pank1Q8K4K6 548 aa26.08■■□□□ 1.77
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nsd2Q8BVE8 1365 aa26.07■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cep170Q6A065 1588 aa26.05■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Htatsf1Q8BGC0 757 aa26.05■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Usp40Q8BWR4 1235 aa26.05■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ecm2Q5FW85 670 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 ShprhQ7TPQ3 1674 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pdcl3Q8BVF2 240 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abca8bQ8K440 1620 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kidins220E9Q9B7 1793 aa26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ccdc183A2AJB1 534 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kcnn1Q9EQR3 537 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa26.03■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc6Q9R1S7 1498 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ttc21bQ0HA38 1315 aa26.02■■□□□ 1.76
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Robo2Q7TPD3 1470 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cluap1Q8R3P7 413 aa26.01■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.99■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ccdc30Q8BVF4 654 aa25.99■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Setd1aE9PYH6 1716 aa25.97■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Hecw1Q8K4P8 1604 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Plcb2A3KGF7 1181 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ak9G3UYQ4 1894 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 ErbinQ80TH2 1402 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa25.96■■□□□ 1.75
Smad4-201ENSMUST00000025393 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 PtprtQ99M80 1454 aa25.94■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mink1Q9JM52 1308 aa25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Plch2A2AP18 1501 aa25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Neurl4Q5NCX5 1563 aa25.93■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa25.92■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Igf1rQ60751 1373 aa25.92■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gas2l2Q5SSG4 860 aa25.91■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa25.9■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tex14Q7M6U3 1450 aa25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.4 ms