RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid3cA6PWV5 409 aa34.89■■■■□ 3.18
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfyve16Q80U44 1528 aa34.87■■■■□ 3.17
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fndc1E9Q043 1732 aa34.75■■■■□ 3.15
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fan1Q69ZT1 1020 aa34.72■■■■□ 3.15
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ak9G3UYQ4 1894 aa34.68■■■■□ 3.14
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo3aQ8K3H5 1613 aa34.65■■■■□ 3.14
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca8aQ8K442 1620 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atf7ipQ7TT18 1306 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcaf11Q91VU6 549 aa34.59■■■■□ 3.13
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prex1Q69ZK0 1650 aa34.57■■■■□ 3.13
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stard8Q8K031 1019 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nlrp6Q91WS2 869 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa34.54■■■■□ 3.12
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc41Q692V3 1318 aa34.51■■■■□ 3.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnga1P29974 684 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa34.48■■■■□ 3.11
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ipo9Q91YE6 1041 aa34.47■■■■□ 3.11
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa34.45■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurod2Q62414 383 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rwdd1Q9CQK7 243 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp19Q3UJD6 1360 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhh1Q80TI1 1356 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gli2Q0VGT2 1544 aa34.42■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apbb1Q9QXJ1 710 aa34.41■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptch1Q61115 1434 aa34.41■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpm1Q2TV84 1622 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll13A4Q9F6 804 aa34.36■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Talpid3E9PV87 1520 aa34.36■■■■□ 3.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efcab6Q6P1E8 1516 aa34.35■■■■□ 3.09
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Depdc5P61460 1591 aa34.35■■■■□ 3.09
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa34.32■■■■□ 3.08
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp10aO54827 1508 aa34.31■■■■□ 3.08
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uspl1Q3ULM6 1089 aa34.22■■■■□ 3.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa34.21■■■■□ 3.07
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PalldQ9ET54 1408 aa34.2■■■■□ 3.07
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