RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa11.96□□□□□ -0.49
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prex2Q3LAC4 1598 aa11.96□□□□□ -0.49
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GsdmaQ9EST1 446 aa11.96□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa11.96□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fgd1P52734 960 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf330Q922H9 316 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adcy10Q8C0T9 1614 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plcb2A3KGF7 1181 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NgefQ8CHT1 710 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gcc2Q8CHG3 1679 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plin1Q8CGN5 517 aa11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CenpjQ569L8 1344 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ralbp1Q62172 648 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Birc3O08863 600 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmco5bQ80X59 307 aa11.94□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf316Q6PGE4 1016 aa11.93□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trappc8E9PWG2 1437 aa11.93□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Shq1Q7TMX5 569 aa11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fancd2Q80V62 1450 aa11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AlkP97793 1621 aa11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tspyl2Q7TQI8 677 aa11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc183A2AJB1 534 aa11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mink1Q9JM52 1308 aa11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp7aQ64430 1491 aa11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adamts12Q811B3 1600 aa11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fhod3Q76LL6 1578 aa11.91□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map7O88735 730 aa11.9□□□□□ -0.5
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim58Q5NCC9 485 aa11.89□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ssh2Q5SW75 1423 aa11.89□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Irx6Q9ER75 438 aa11.89□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa11.89□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AU015836B2RUM3 263 aa11.87□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc21bQ0HA38 1315 aa11.87□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Apaf1O88879 1249 aa11.87□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SphkapQ6NSW3 1687 aa11.86□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Txndc2Q6P902 515 aa11.86□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp10dQ8K2X1 1416 aa11.86□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Psme1P97371 249 aa11.85□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim44Q9QXA7 346 aa11.85□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc60Q8C4J0 545 aa11.84□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgef11Q68FM7 1552 aa11.84□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igf1rQ60751 1373 aa11.83□□□□□ -0.51
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Setbp1Q9Z180 1582 aa11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AI481877A2ALV5 1481 aa11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nkx1-2P42580 305 aa11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atxn3Q9CVD2 355 aa11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9D9H8 365 aa11.83□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GorabQ8BRM2 368 aa11.82□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa11.82□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map3k4O08648 1597 aa11.81□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gsto1O09131 240 aa11.8□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PtprgQ05909 1442 aa11.8□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa11.8□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mbd5B1AYB6 1498 aa11.79□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa11.79□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rabep1O35551 862 aa11.79□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pibf1E9Q6K3 756 aa11.78□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nutm1Q8BHP2 1126 aa11.78□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abca16E9PWJ7 1678 aa11.78□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rfx1P48377 963 aa11.77□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa11.77□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa11.77□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa11.77□□□□□ -0.52
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sox12Q04890 314 aa11.77□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gas2l2Q5SSG4 860 aa11.77□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rsph4aQ8BYM7 716 aa11.76□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nectin2P32507 530 aa11.76□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dusp27Q148W8 1138 aa11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SlkO54988 1233 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.4 ms