RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rhox8Q6VSS7 320 aa16.86■□□□□ 0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NischQ80TM9 1593 aa16.49■□□□□ 0.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abcc9P70170 1546 aa15.7■□□□□ 0.1
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa15.54■□□□□ 0.08
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa15.4■□□□□ 0.06
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abcc8B2RUS7 1588 aa15.38■□□□□ 0.05
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa15.28■□□□□ 0.04
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc180J3QNE4 1664 aa15.27■□□□□ 0.03
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rtl1Q7M732 1744 aa15.25■□□□□ 0.03
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim41Q5NCC3 630 aa14.97□□□□□ -0.01
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cngb1E1AZ71 1325 aa14.87□□□□□ -0.03
Clstn3-201ENSMUST00000008297 HrcG5E8J6 738 aa14.85□□□□□ -0.03
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gab3Q8BSM5 595 aa14.78□□□□□ -0.04
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pcgf6Q99NA9 353 aa14.7□□□□□ -0.06
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zeb1Q64318 1117 aa14.6□□□□□ -0.07
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa14.45□□□□□ -0.1
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dcaf1Q80TR8 1506 aa14.45□□□□□ -0.1
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myt1lP97500 1187 aa14.34□□□□□ -0.11
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr66E9Q743 1299 aa14.32□□□□□ -0.12
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Npm2Q80W85 207 aa14.3□□□□□ -0.12
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NefmP08553 848 aa14.28□□□□□ -0.12
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
Clstn3-201ENSMUST00000008297 UbtfP25976 765 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Baz1aO88379 1555 aa14.2□□□□□ -0.14
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cep164Q5DU05 1446 aa14.18□□□□□ -0.14
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NacadQ5SWP3 1504 aa14.17□□□□□ -0.14
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chic1Q8CBW7 227 aa14.15□□□□□ -0.14
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mier1Q5UAK0 511 aa14.14□□□□□ -0.15
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kdm5dQ62240 1548 aa14.14□□□□□ -0.15
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Neurod1Q60867 357 aa14.09□□□□□ -0.15
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ScribQ80U72 1612 aa14.01□□□□□ -0.17
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa14□□□□□ -0.17
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il27Q8K3I6 234 aa13.99□□□□□ -0.17
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sall2Q9QX96 1004 aa13.97□□□□□ -0.17
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube2uB1AUC4 352 aa13.84□□□□□ -0.19
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa13.82□□□□□ -0.2
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Golga3P55937 1487 aa13.79□□□□□ -0.2
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa13.75□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CenpbP27790 599 aa13.74□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 TonslQ6NZL6 1363 aa13.73□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa13.73□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Crybg2B7ZCC2 1516 aa13.73□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Csrnp3P59055 597 aa13.72□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sycp2Q9CUU3 1500 aa13.71□□□□□ -0.21
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Smarca2Q6DIC0 1577 aa13.7□□□□□ -0.22
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ClspnQ80YR7 1315 aa13.7□□□□□ -0.22
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Anks4bQ8K3X6 423 aa13.7□□□□□ -0.22
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa13.63□□□□□ -0.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Clip1Q922J3 1391 aa13.61□□□□□ -0.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm38655A0A286YDK6 273 aa13.59□□□□□ -0.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa13.58□□□□□ -0.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eid3Q3V124 375 aa13.55□□□□□ -0.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lmod2Q3UHZ5 550 aa13.52□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NclP09405 707 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CftrP26361 1476 aa13.49□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Synj1Q8CHC4 1574 aa13.47□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa13.46□□□□□ -0.25
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc24a1Q91WD8 1130 aa13.45□□□□□ -0.26
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Aplp2Q06335 707 aa13.42□□□□□ -0.26
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tnnt3Q9QZ47 272 aa13.39□□□□□ -0.27
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stra8P70278 393 aa13.38□□□□□ -0.27
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myt1Q8CFC2 1127 aa13.35□□□□□ -0.27
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fmn1Q05860 1466 aa13.35□□□□□ -0.27
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cep162Q6ZQ06 1403 aa13.34□□□□□ -0.27
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Setd5Q5XJV7 1441 aa13.33□□□□□ -0.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kif15Q6P9L6 1387 aa13.33□□□□□ -0.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ubl4bQ9CQ84 188 aa13.33□□□□□ -0.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BlmO88700 1416 aa13.29□□□□□ -0.28
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eea1Q8BL66 1411 aa13.26□□□□□ -0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa13.25□□□□□ -0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa13.23□□□□□ -0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc18Q640L5 1455 aa13.15□□□□□ -0.3
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ercc6F8VPZ5 1481 aa13.14□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chic2Q9D9G3 165 aa13.14□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BicraF8VPZ9 1578 aa13.13□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa13.13□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NrdcQ8BHG1 1161 aa13.12□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccer2J3QPU5 274 aa13.12□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam71e1A1L3C1 212 aa13.1□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Anp32aO35381 247 aa13.1□□□□□ -0.31
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 118.5 ms