RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C RAS2P01120 322 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C FBA1P14540 359 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C URA6P15700 204 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YMR31P19955 123 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SCL1P21243 252 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PPA2P28239 310 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data0.99□□□□□ -2.25not detected
HDA3YPR179C OTU1P43558 301 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YGR219WP53307 113 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ABF2Q02486 183 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NEJ1Q06148 342 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ARR2Q06597 130 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C HEM25Q07534 307 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YPR170W-BP0C5R9 85 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SSO1P32867 290 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SRY1P36007 326 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C URA8P38627 578 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C TCD1P38756 429 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YHR180WP38868 163 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MIC26P50087 233 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ALG13P53178 202 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C FYV6P53913 173 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YMD8Q03697 442 aa0.99□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DRS2P39524 1355 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CDC8P00572 216 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C OAC1P32332 324 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DOG2P38773 246 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RSM25P40496 264 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YML108WQ03759 105 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RNH1Q04740 348 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C BOL1Q3E793 110 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SEY1Q99287 776 aa0.98□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPL28P02406 149 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YBR121C-AP0C5L4 52 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PBN1P25580 416 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ERV15P38312 142 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C IRC22P40006 225 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C AYR1P40471 297 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MSS2P40990 351 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C BAT2P47176 376 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C BRR6P53062 197 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DID2P69771 204 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CYT2Q00873 224 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data0.97□□□□□ -2.25not detected
HDA3YPR179C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DCN1Q12395 269 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YKL183C-AQ3E765 70 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DBF2P22204 572 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YHR022CP38763 256 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ERG28P40030 148 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C LSM4P40070 187 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YKE4P40544 346 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PRM10P42946 383 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C GCN20P43535 752 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NUP57P48837 541 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ERG25P53045 309 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C TRM12Q04235 462 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C LPP1Q04396 274 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PSF1Q12488 208 aa0.97□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ARG80P07249 177 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C COQ1P18900 473 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C ATG22P25568 528 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YNL194CP40169 301 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C BMT5P40493 336 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YRB1P41920 201 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C BXI1P48558 297 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YNR062CP53748 327 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YDR248CQ03786 193 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C USB1Q12208 290 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C DDI2P0CH63 225 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C DDI3P0CH64 225 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PET9P18239 318 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C STE18P18852 110 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PEP8P40335 379 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C FAR7P43592 221 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YFR054CP43622 192 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C ADO1P47143 340 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C RAD17P48581 401 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MGA1P53050 456 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C PRM8P53174 237 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C JLP1Q12358 412 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C TDA8Q6B2U8 126 aa0.96□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YDR157WA0A023PZE8 133 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C REP2P03872 296 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C CDC33P07260 213 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YLR156WP0CE96 114 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YLR159WP0CE97 114 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C YLR161WP0CE98 114 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C MEI4P29467 408 aa0.95□□□□□ -2.26
HDA3YPR179C APS1P35181 156 aa0.95□□□□□ -2.26
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