Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.13■□□□□ 0.81
TRM12Q04235 NSR1YGR159C 1245 nt20.02■□□□□ 0.8
TRM12Q04235 NOP1YDL014W 984 nt19.46■□□□□ 0.71
TRM12Q04235 YKL036CYKL036C 393 nt17.95■□□□□ 0.46
TRM12Q04235 MDJ1YFL016C 1536 nt17.93■□□□□ 0.46
TRM12Q04235 Q0297Q0297 156 nt17.08■□□□□ 0.32
TRM12Q04235 SRX1YKL086W 384 nt17.06■□□□□ 0.32
TRM12Q04235 YJL027CYJL027C 417 nt16.78■□□□□ 0.28
TRM12Q04235 SCS3YGL126W 1143 nt16.36■□□□□ 0.21
TRM12Q04235 YCR051WYCR051W 669 nt16.19■□□□□ 0.18
TRM12Q04235 DBP2YNL112W 1641 nt15.86■□□□□ 0.13
TRM12Q04235 YOL085CYOL085C 342 nt15.6■□□□□ 0.09
TRM12Q04235 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM12Q04235 PKP1YIL042C 1185 nt15.4■□□□□ 0.06
TRM12Q04235 CCC1YLR220W 969 nt15.34■□□□□ 0.05
TRM12Q04235 RPP1BYDL130W 321 nt15.32■□□□□ 0.04
TRM12Q04235 YBR190WYBR190W 312 nt15.22■□□□□ 0.03
TRM12Q04235 RTC3YHR087W 336 nt14.88□□□□□ -0.03
TRM12Q04235 SCJ1YMR214W 1134 nt14.82□□□□□ -0.04
TRM12Q04235 RVS167YDR388W 1449 nt14.75□□□□□ -0.05
TRM12Q04235 PET122YER153C 765 nt14.69□□□□□ -0.06
TRM12Q04235 ATS1YAL020C 1002 nt14.65□□□□□ -0.06
TRM12Q04235 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
TRM12Q04235 SCR1SCR1 522 nt14.44□□□□□ -0.1
TRM12Q04235 SHR5YOL110W 714 nt14.28□□□□□ -0.12
TRM12Q04235 RRN5YLR141W 1092 nt14.26□□□□□ -0.13
TRM12Q04235 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
TRM12Q04235 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
TRM12Q04235 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.98□□□□□ -0.17
TRM12Q04235 PUT4YOR348C 1884 nt13.97□□□□□ -0.17
TRM12Q04235 DEP1YAL013W 1218 nt13.95□□□□□ -0.18
TRM12Q04235 URN1YPR152C 1398 nt13.94□□□□□ -0.18
TRM12Q04235 RSB1YOR049C 1065 nt13.91□□□□□ -0.18
TRM12Q04235 GAR1YHR089C 618 nt13.85□□□□□ -0.19
TRM12Q04235 OPI9YLR338W 858 nt13.73□□□□□ -0.21
TRM12Q04235 SAH1YER043C 1350 nt13.71□□□□□ -0.22
TRM12Q04235 ARE1YCR048W 1833 nt13.67□□□□□ -0.22
TRM12Q04235 YNL208WYNL208W 600 nt13.66□□□□□ -0.22
TRM12Q04235 RPN10YHR200W 807 nt13.63□□□□□ -0.23
TRM12Q04235 PST2YDR032C 597 nt13.55□□□□□ -0.24
TRM12Q04235 POA1YBR022W 534 nt13.49□□□□□ -0.25
TRM12Q04235 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.48□□□□□ -0.25
TRM12Q04235 TIR1YER011W 765 nt13.38□□□□□ -0.27
TRM12Q04235 PUN1YLR414C 792 nt13.3□□□□□ -0.28
TRM12Q04235 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
TRM12Q04235 SSA1YAL005C 1929 nt13.28□□□□□ -0.28
TRM12Q04235 YJR018WYJR018W 363 nt13.27□□□□□ -0.29
TRM12Q04235 PTC2YER089C 1395 nt13.2□□□□□ -0.3
TRM12Q04235 YJR120WYJR120W 351 nt13.17□□□□□ -0.3
TRM12Q04235 BUD23YCR047C 828 nt13.14□□□□□ -0.31
TRM12Q04235 SRB2YHR041C 633 nt13.14□□□□□ -0.31
TRM12Q04235 YKL097CYKL097C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
TRM12Q04235 SHU1YHL006C 453 nt13.03□□□□□ -0.32
TRM12Q04235 NAB2YGL122C 1578 nt13□□□□□ -0.33
TRM12Q04235 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
TRM12Q04235 RPP2BYDR382W 333 nt12.93□□□□□ -0.34
TRM12Q04235 FIS1YIL065C 468 nt12.89□□□□□ -0.35
TRM12Q04235 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.87□□□□□ -0.35
TRM12Q04235 DAL1YIR027C 1383 nt12.83□□□□□ -0.36
TRM12Q04235 WWM1YFL010C 636 nt12.82□□□□□ -0.36
TRM12Q04235 FPR4YLR449W 1179 nt12.81□□□□□ -0.36
TRM12Q04235 INM2YDR287W 879 nt12.77□□□□□ -0.37
TRM12Q04235 PHO4YFR034C 939 nt12.74□□□□□ -0.37
TRM12Q04235 BDH2YAL061W 1254 nt12.71□□□□□ -0.37
TRM12Q04235 SSA4YER103W 1929 nt12.69□□□□□ -0.38
TRM12Q04235 YBL100CYBL100C 315 nt12.68□□□□□ -0.38
TRM12Q04235 HOM6YJR139C 1080 nt12.66□□□□□ -0.38
TRM12Q04235 MNP1YGL068W 585 nt12.63□□□□□ -0.39
TRM12Q04235 YGR021WYGR021W 873 nt12.63□□□□□ -0.39
TRM12Q04235 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.55□□□□□ -0.4
TRM12Q04235 FUN26YAL022C 1554 nt12.54□□□□□ -0.4
TRM12Q04235 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 LSM3YLR438C-A 270 nt12.51□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 YOR139CYOR139C 393 nt12.51□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 YPS1YLR120C 1710 nt12.51□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 RKM5YLR137W 1104 nt12.47□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 TRM9YML014W 840 nt12.46□□□□□ -0.41
TRM12Q04235 NPL3YDR432W 1245 nt12.43□□□□□ -0.42
TRM12Q04235 YDR095CYDR095C 411 nt12.42□□□□□ -0.42
TRM12Q04235 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
TRM12Q04235 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.35□□□□□ -0.43
TRM12Q04235 YOL037CYOL037C 354 nt12.33□□□□□ -0.44
TRM12Q04235 ALF1YNL148C 765 nt12.32□□□□□ -0.44
TRM12Q04235 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
TRM12Q04235 BDF1YLR399C 2061 nt12.24□□□□□ -0.45
TRM12Q04235 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.21□□□□□ -0.45
TRM12Q04235 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.21□□□□□ -0.45
TRM12Q04235 PTP1YDL230W 1008 nt12.2□□□□□ -0.46
TRM12Q04235 SIS1YNL007C 1059 nt12.19□□□□□ -0.46
TRM12Q04235 RPP2AYOL039W 321 nt12.17□□□□□ -0.46
TRM12Q04235 EMI2YDR516C 1503 nt12.13□□□□□ -0.47
TRM12Q04235 CAC2YML102W 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.9 ms