RNA–Protein interactions for RNA: YGL139W

FLC3, Transcript of Putative FAD transporter, similar to Flc1p and Flc2p, yeast

Gene FLC3, Length 2,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLC3	YGL139W	YHL026C	P38740	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YHC3	P47040	408 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
FLC3	YGL139W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	TRM10	Q12400	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	BI2	P03873	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MGT1	P26188	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YPS1	P32329	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	GET2	P40056	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	FAR3	P46671	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YGR149W	P48236	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SAY1	P53324	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	HHT1	P61830	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	POS5	Q06892	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	PEX27	Q08580	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	FCY2	P17064	533 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	IRC8	P47046	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	XPT1	P47165	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	UBC11	P52492	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MTL1	P53214	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	CPR8	P53728	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YNR048W	P53740	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	NAT5	Q08689	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLR415C	O13578	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	NNK1	P36003	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	NMA2	P53204	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MAK3	Q03503	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	PRM6	Q04705	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	GPI12	P23797	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SNC2	P33328	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	AYR1	P40471	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MEP2	P41948	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
FLC3	YGL139W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YDL186W	P48568	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MIC26	P50087	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SUR7	P54003	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	SUE1	Q06524	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	COQ5	P49017	307 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	MUP1	P50276	574 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	COQ11	Q05892	277 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
FLC3	YGL139W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	ERD1	P16151	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	MIG1	P27705	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	OAC1	P32332	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	SYS1	P41544	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	CDH1	P53197	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	SCW10	Q04951	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	TDA6	Q06466	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	COQ10	Q08058	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	POM34	Q12445	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	PDE1	P22434	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	GAA1	P39012	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	AVT2	P39981	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	VMA21	P41806	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	YFL040W	P43562	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	SCS3	P53012	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	APJ1	P53940	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	CYT2	Q00873	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	INM2	Q05533	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	CHO1	P08456	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	CTF8	P38877	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	FAA2	P39518	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	YEL075C	P39972	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FLC3	YGL139W	SAS2	P40963	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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