RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PET20Q99373 253 aa3.48□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W Q0297Q9ZZV8 51 aa3.48□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W FMT1P32785 401 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YIL060WP40519 144 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YIR020CP40575 100 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W CAT5P41735 233 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W OTU1P43558 301 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W NCA3P46955 337 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YNR064CP53750 290 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SYM1Q06563 197 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ATP10P18496 279 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PCL1P24867 279 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SRY1P36007 326 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W POP2P39008 433 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MIT1P40002 666 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SLM1P40485 686 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GON7P46984 123 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W RSM27P53305 110 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SCP1Q08873 200 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W BBP1Q12365 385 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GEP5Q12393 293 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PRM4Q12498 284 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MEC1P38111 2368 aa3.47□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YCL042WP25572 119 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W OCH1P31755 480 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MRP20P32387 263 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W UTP30P36144 274 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W AIM46P38885 310 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.85not detected
SPC105YGL093W YIL012WP40551 113 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W FMP48P53233 369 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MRPL22P53881 309 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ARG5,6Q01217 863 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SNA4Q07549 140 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YLR031WQ07978 186 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YNG1Q08465 219 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SCM3Q12334 223 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W EAF3Q12432 401 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ISN1Q99312 450 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W UBA3Q99344 299 aa3.46□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W PET122P10355 254 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W LSB5P25369 354 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W ERG3P32353 365 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W VAM7P32912 316 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W SWM2P40342 146 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W ATF1P40353 525 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W ALG9P53868 555 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W HRD1Q08109 551 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W FRE8Q12209 686 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W CKA1P15790 372 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YBL010CP32788 280 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YGR042WP53227 271 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YML018CQ03730 393 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W VAM3Q12241 283 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W RTR2Q12378 196 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.46□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W PUT1P09368 476 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W HEM13P11353 328 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YMR31P19955 123 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W ATG22P25568 528 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W RPB7P34087 171 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YHR122WP38829 231 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W BNA2P47125 453 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W TTI2P47168 421 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YGL114WP53134 725 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W MRPL13Q02204 264 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W MEH1Q02205 184 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YDL086WQ07505 273 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W NPL6P32832 435 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YKE4P40544 346 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YJL118WP47022 219 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W NIF3P53081 288 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W INN1P53901 409 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W HSK3P69852 69 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W BUD25P85052 153 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W HED1Q03937 162 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W FIT1Q04433 528 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W YOR292CQ08743 309 aa3.45□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W RPL39P04650 51 aa3.44□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W QCR2P07257 368 aa3.44□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SPC105YGL093W NOP16P40007 231 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.8 ms