RNA–Protein interactions for RNA: YGR088W

CTT1, Transcript of Cytosolic catalase T, yeast

Gene CTT1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTT1	YGR088W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	AVT4	P50944	713 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ROG1	P53118	685 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	HHO1	P53551	258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ATG21	Q02887	496 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ATG10	Q07879	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	IZH3	Q07959	543 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RKI1	Q12189	258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	COX3	P00420	269 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	COX5B	P00425	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ADH7	P25377	361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	MRP49	P32388	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	SFC1	P33303	322 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	EMC3	P36039	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
CTT1	YGR088W	SDP1	P40479	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	SNM1	P40993	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	POP1	P41812	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YCH1	P42937	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	MDM34	P53083	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YGR015C	P53208	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	MTL1	P53214	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	DAD3	P69850	94 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ABF2	Q02486	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	STD1	Q02794	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	CCE1	Q03702	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	TEN1	Q07921	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
CTT1	YGR088W	ATG41	Q12048	136 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	PEX11	Q12462	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	NFS1	P25374	497 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	COQ3	P27680	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	OCH1	P31755	480 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	MSK1	P32048	576 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	PDC2	P32896	925 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	SRY1	P36007	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	AVT5	P38176	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YHR177W	P38867	453 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ALP1	P38971	573 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	VPS25	P47142	202 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	TMA23	Q03525	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	ELP6	Q04868	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	TMA10	Q06177	86 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	NDD1	Q08887	554 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	TFC7	Q12415	435 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	PCL9	Q12477	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CTT1	YGR088W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	SRB6	P32570	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	TRS65	P32893	560 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	DOG2	P38773	246 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YNL194C	P40169	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	MOB1	P40484	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YIL024C	P40543	189 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YIR016W	P40572	265 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	AIM25	P47140	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	PHO23	P50947	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	FRE4	P53746	719 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	VPS28	Q02767	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	ELC1	Q03071	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	SEI1	Q06058	285 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	IPK1	Q06667	281 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	DAP1	Q12091	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	RDI1	Q12434	202 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	SAL1	D6W196	494 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	VAR1	P02381	398 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	DAL82	P21705	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	SEC22	P22214	214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	TRX3	P25372	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YEF1	P32622	495 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	GMH1	P36125	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	OMA1	P36163	345 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YBR013C	P38215	129 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	RTC2	P38279	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	YPC1	P38298	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CTT1	YGR088W	LAG1	P38703	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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