RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BRR6	P53062	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CGR1	P53188	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	OKP1	P53298	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HHO1	P53551	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SWS2	P53937	143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BNA7	Q04066	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HNM1	P19807	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NFS1	P25374	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	VAM7	P32912	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SRX1	P36077	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	UMP1	P38293	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	FMO1	P38866	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PFS1	P38872	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	IKI1	P38874	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SLZ1	P40167	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	POG1	P40473	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NIF3	P53081	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YIP4	P53093	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YGL117W	P53133	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CAB5	Q03941	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SNX41	Q04053	625 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	IRC19	Q07843	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	GRC3	Q07845	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SCP1	Q08873	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	VAM3	Q12241	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ISN1	Q99312	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	OPI3	P05375	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RPB8	P20436	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MSK1	P32048	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YBL010C	P32788	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	COS9	P36034	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YKL162C	P36052	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	POP8	P38208	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YIL067C	P40514	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YIL024C	P40543	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	CIS3	P47001	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MRX5	P47007	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SSN8	P47821	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	UFD1	P53044	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PKP2	P53170	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NCE103	P53615	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SAM50	P53969	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HEM25	Q07534	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	THI72	Q08579	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HNT3	Q08702	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	IMG1	P25626	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	ERG3	P32353	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
PUS1	YPL212C	FMT1	P32785	401 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	FRM2	P37261	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	APD1	P38281	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SDH8	P38345	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	GTT1	P40582	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	HNT2	P49775	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	UBP8	P50102	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	AAH1	P53909	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	PET191	Q02772	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	BNA5	Q05979	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	DCS1	Q06151	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	TDA6	Q06466	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SYM1	Q06563	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	RRT7	Q07829	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	MIM1	Q08176	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS1	YPL212C	REX3	Q12090	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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