RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C UTR5P32630 166 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YOX1P34161 385 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C LOT5P34234 306 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YKL102CP34249 101 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C OMA1P36163 345 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C LDB7P38210 180 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YBR096WP38256 230 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C EFM1P38732 585 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MET30P39014 640 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YEL057CP39983 233 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C GIP2P40036 548 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ICP55P40051 511 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YER188WP40103 239 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C LRO1P40345 661 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YIL012WP40551 113 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MET28P40573 187 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C NNF1P47149 201 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FLC3P53121 802 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YIF1P53845 314 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C OAZ1Q02803 292 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ELC1Q03071 99 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C EST3Q03096 181 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RCE1Q03530 315 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YDR132CQ03900 495 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C UPS3Q04006 179 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TY1A-MR1Q04215 440 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CRF1Q04930 467 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C HRD3Q05787 833 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PUS5Q06244 254 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YLR040CQ07988 224 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BSC1Q12140 328 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TY1A-BLQ12266 440 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C HUT1Q12520 339 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YIR021W-AQ3E739 70 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YRF1-3P0CX14 1859 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YRF1-7P0CX15 1859 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ECM29P38737 1868 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YRF1-6P53819 1859 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RAS2P01120 322 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YER190C-BP0CX94 160 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ANB1P19211 157 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C NUP1P20676 1076 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SRM1P21827 482 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BOS1P25385 244 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C VBA3P25594 458 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C GEX1P25596 615 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ATG15P25641 520 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C URK1P27515 501 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9 RIP-Chip
SPT4YGR063C PRY2P36110 329 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C AIM3P38266 947 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ARP1P38696 384 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YHR177WP38867 453 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SSN3P39073 555 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BDH1P39714 382 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C VAC8P39968 578 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C IRC22P40006 225 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SMB1P40018 196 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ELO3P40319 345 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YIL067CP40514 678 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PHS1P40857 217 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CAT5P41735 233 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C QRI7P43122 407 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YHC3P47040 408 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MTO1P53070 669 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BOL2P53082 120 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PNC1P53184 216 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YGR035CP53222 116 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YGR066CP53242 292 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YGR126WP53274 230 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C EOS1P53938 366 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CTF19Q02732 369 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C IRC15Q02733 499 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YDR391CQ04170 232 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TMN2Q04562 672 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ARG7Q04728 441 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YLR456WQ06199 204 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C IRC10Q08118 586 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TMS1Q12116 473 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FRE8Q12209 686 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SUL2Q12325 893 aa3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
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