RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W SHU2P38957 223 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YEL075CP39972 122 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ARG2P40360 574 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YIL054WP40524 105 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W VMA21P41806 77 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YFL054CP43549 646 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W NSG2P53898 299 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YNL092WP53934 400 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GRX5Q02784 150 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ADI1Q03677 179 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YPR109WQ06104 294 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SHS1Q07657 551 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W COQ10Q08058 207 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W INP54Q08227 384 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLL056CQ12177 298 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TY4B-HP0C2J7 1802 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W VAR1P02381 398 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YPR170W-BP0C5R9 85 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W STE18P18852 110 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPB5P20434 215 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YKR051WP36142 418 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SRP68P38687 599 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SKN7P38889 622 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W BAT1P38891 393 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GET2P40056 285 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RRG9P40156 214 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YIL152WP40455 235 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPA43P46669 326 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ERV29P53337 310 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DUS1P53759 423 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W BSP1Q06604 576 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AAD15Q08361 143 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PER33Q12144 273 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLL058WQ12198 575 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W WSC3Q12215 556 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TY4B-JP47024 1803 aa4.72□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YPT1P01123 206 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PCL1P24867 279 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YCR015CP25616 317 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ARP2P32381 391 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SYS1P41544 203 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W LST7P53237 242 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W BIO4P53630 237 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W LSM7P53905 115 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ATG21Q02887 496 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W BNA5Q05979 453 aa4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CAR1P00812 333 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CYC3P06182 269 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W NUC1P08466 329 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data4.71□□□□□ -1.66not detected
CYK3YDL117W MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W LSB5P25369 354 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YEF1P32622 495 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W FMT1P32785 401 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MAC1P35192 417 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CTP1P38152 299 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SSN3P39073 555 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W LYS12P40495 371 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SUT1P53032 299 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YIP4P53093 235 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YNR014WP53719 212 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W AAH1P53909 347 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W XYL2Q07993 356 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.71□□□□□ -1.66not detected
CYK3YDL117W YPR027CQ12079 277 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YDL177CQ12257 170 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W GEP5Q12393 293 aa4.71□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ATP10P18496 279 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TIR2P33890 251 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W DOG1P38774 246 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SWM2P40342 146 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CHA4P43634 648 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YGL114WP53134 725 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YOL131WQ08270 108 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SFG1Q12507 346 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CPR2P23285 205 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ERG6P25087 383 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MUD1P32605 298 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W LDB7P38210 180 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W AIM34Q03673 198 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SEI1Q06058 285 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MMT2Q08970 484 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W BTS1Q12051 335 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YCT1Q12235 531 aa4.7□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ERS1P17261 260 aa4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SNF5P18480 905 aa4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ERV1P27882 189 aa4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TRR1P29509 319 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W EMP24P32803 203 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CUE1P38428 203 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.7 ms