RNA–Protein interactions for RNA: YJL089W

SIP4, Transcript of C6 zinc cluster transcriptional activator, yeast

Gene SIP4, Length 2,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP4	YJL089W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	STB1	P42845	420 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NCA3	P46955	337 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YJL055W	P47044	245 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	CCC1	P47818	322 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	RMR1	P53060	241 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	MEP3	P53390	489 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ASI1	P54074	624 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	HHT1	P61830	136 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SED1	Q01589	338 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SPR6	Q01684	191 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SKO1	Q02100	647 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YDC1	Q02896	317 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YMR279C	Q03263	540 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	AIM36	Q03798	255 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YPR098C	Q06089	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	IPK1	Q06667	281 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	RFU1	Q08003	200 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	FIT3	Q08907	204 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NFI1	Q12216	726 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
SIP4	YJL089W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	CCW14	O13547	238 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PDE2	P06776	526 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PMR1	P13586	950 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	MSI1	P13712	422 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YCR100C	P25606	316 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ECT1	P33412	323 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SPC29	P33419	253 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YKL102C	P34249	101 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PRY2	P36110	329 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	THI2	P38141	450 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	GPI18	P38211	433 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YBR138C	P38277	524 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YER121W	P40076	114 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	BUR6	P40096	142 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PUG1	P40100	303 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YIL029C	P40538	142 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
SIP4	YJL089W	EGT2	P42835	1041 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	CIN2	P46670	268 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	LOH1	P47055	219 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	BNA1	P47096	177 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	HMS2	P47175	358 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	UBC13	P52490	153 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	GEP7	P53171	287 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	MTL1	P53214	551 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YNR048W	P53740	393 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SAM50	P53969	484 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	HFD1	Q04458	532 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ARP10	Q04549	284 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ECM18	Q04623	453 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ELP6	Q04868	273 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NNT1	Q05874	261 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	CTS2	Q06350	511 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	FRE3	Q08905	711 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SPC3	Q12133	184 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	TAF3	Q12297	353 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	HMS1	Q12398	434 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PCL9	Q12477	304 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	IRA1	P18963	3092 aa		0.99	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	OPI3	P05375	206 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	TPK3	P05986	398 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	DBF2	P22204	572 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SED4	P25365	1065 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PTP2	P29461	750 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	NTG1	P31378	399 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	OAC1	P32332	324 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	GSH1	P32477	678 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	IES6	P32617	166 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	REC114	P32841	428 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	YOX1	P34161	385 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	SBE22	P38814	852 aa		0.98	□□□□□ -2.25
SIP4	YJL089W	ECM14	P38836	430 aa		0.98	□□□□□ -2.25

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