RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	TIR3	P40552	269 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MAL12	P53341	584 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	GIS1	Q03833	894 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	IPK1	Q06667	281 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	HRT1	Q08273	121 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.12	□□□□□ -1.59	not detected
AMD1	YML035C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	STF2	P16965	84 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	DTR1	P38125	572 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PEX32	P38292	413 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	REE1	P40893	198 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	GDS1	P41913	522 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YGR210C	P42942	411 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MNN5	P46982	586 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ATG4	P53867	494 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PLB2	Q03674	706 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	GPN3	Q06543	272 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YOL114C	Q12322	202 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SOD2	P00447	233 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	HMG1	P12683	1054 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PDX1	P16451	410 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	STE50	P25344	346 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	KAE1	P36132	386 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YHR122W	P38829	231 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SFH5	P47008	294 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	NUP116	Q02630	1113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MIX14	Q04341	121 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PHO92	Q06390	306 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YOR378W	Q08902	515 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	CDC9	P04819	755 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	UTR1	P21373	530 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	FUN26	P31381	517 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	THI4	P32318	326 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
AMD1	YML035C	SDS22	P36047	338 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YJR120W	P47157	116 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YGR126W	P53274	230 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ISU1	Q03020	165 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SDC1	Q03323	175 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	DLT1	Q04216	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ASR1	Q06834	288 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ATG41	Q12048	136 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	FRE6	Q12473	712 aa		5.11	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RPB10	P22139	70 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	NFS1	P25374	497 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	BOS1	P25385	244 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ATS1	P31386	333 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YBR063C	P38083	404 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	THI2	P38141	450 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MOH1	P38191	138 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PHO90	P39535	881 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SDP1	P40479	209 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	LYS5	P50113	272 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	JAC1	P53193	184 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	VOA1	P53262	265 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PAU12	P53343	120 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	DID2	P69771	204 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	TPO3	Q06451	622 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	FLO9	P39712	1322 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	DIT1	P21623	536 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	VPS17	P32913	551 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	MBA1	P38300	278 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	CHS7	P38843	316 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	NAS2	P40555	220 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SAY1	P53324	424 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SUR7	P54003	302 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	BNA7	Q04066	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	QCR7	P00128	127 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	COX9	P07255	59 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	CPR2	P23285	205 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	ADH7	P25377	361 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PHM8	P40025	321 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	SHO1	P40073	367 aa		5.09	□□□□□ -1.59
AMD1	YML035C	PMT6	P42934	759 aa		5.09	□□□□□ -1.59

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