RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C DTR1P38125 572 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C RTC2P38279 296 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C HTD2P38790 280 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C LRO1P40345 661 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PAN6P40459 309 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C OPT1P40897 799 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C POP1P41812 875 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C TAD2P47058 250 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PHB2P50085 310 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C OKP1P53298 406 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C EFM6P53970 246 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ASI3P53983 676 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C VBA1Q04301 562 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YOR385WQ08909 290 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C BTS1Q12051 335 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C TGS1Q12052 315 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C HMS1Q12398 434 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SNF8Q12483 233 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YCL012CQ8J0M4 134 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C FSH3Q99369 266 aa3.5□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C GAL80P04387 435 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C NAM2P11325 894 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SEC12P11655 471 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MRPL8P22353 238 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C STE50P25344 346 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MRP17P28778 131 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MRPL9P31334 269 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SUA5P32579 426 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SHP1P34223 423 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C COS9P36034 407 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
SOP4YJL192C SDH4P37298 181 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C AGP2P38090 596 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
SOP4YJL192C YPT31P38555 223 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C GND1P38720 489 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YHL041WP38730 149 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YHR035WP38769 630 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C UBA4P38820 440 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YHR122WP38829 231 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PRP39P39682 629 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C VAB2P40003 282 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C AGE2P40529 298 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C NSE4P43124 402 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C AIM25P47140 327 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MCM22P47167 239 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DAN1P47178 298 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PKP2P53170 491 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C TIM21P53220 239 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C VOA1P53262 265 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C HOL1P53389 586 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C NRK1P53915 240 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
SOP4YJL192C YDC1Q02896 317 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ELP6Q04868 273 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SWC7Q06707 132 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C GEP3Q08622 556 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C NMD4Q12129 218 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
SOP4YJL192C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ERP3Q12403 225 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C RRI1Q12468 440 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C FRE6Q12473 712 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SKS1Q12505 502 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MHT1Q12525 324 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YCL001W-BQ96VH2 84 aa3.49□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C COX3P00420 269 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C COX9P07255 59 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DST1P07273 309 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C MET2P08465 486 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C HOM3P10869 527 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C REV1P12689 985 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C ZRC1P20107 442 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SEC22P22214 214 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DCC1P25559 380 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C YIH1P25637 258 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C GAC1P28006 793 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C DOA4P32571 926 aa3.48□□□□□ -1.85
SOP4YJL192C SEF1P34228 1148 aa3.48□□□□□ -1.85
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