RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	KAE1	P36132	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	LDH1	P38139	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	POA1	P38218	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RPL28	YGL103W	RGA1	P39083	1007 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MNT3	P40549	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FLC3	P53121	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	NRK1	P53915	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ROT1	Q03691	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SNX41	Q04053	625 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SNO4	Q04902	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HSP32	Q08992	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RRI1	Q12468	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ISN1	Q99312	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GAL4	P04386	881 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HIP1	P06775	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	COX9	P07255	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FUS1	P11710	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CDC34	P14682	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SEC22	P22214	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GPI12	P23797	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PBN1	P25580	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SIP1	P32578	815 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	DCW1	P36091	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	OMA1	P36163	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MAL32	P38158	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	IKI1	P38874	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YEL068C	P39977	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PGD1	P40356	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YIL166C	P40445	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ICE2	P40499	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YHC3	P47040	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SSN8	P47821	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SRB7	P47822	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MAL12	P53341	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HHO1	P53551	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FYV6	P53913	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ODC1	Q03028	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	EAF1	Q06337	982 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	AIM6	Q07716	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MMP1	Q12372	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	GAL1	P04385	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	NPR1	P22211	790 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	AGP1	P25376	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	CWH43	P25618	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
RPL28	YGL103W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	ECM15	P35195	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	CHK1	P38147	527 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	CDS1	P38221	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	PUG1	P40100	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	YNL195C	P40168	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	GTT1	P40582	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	NSE4	P43124	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	YNR062C	P53748	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
RPL28	YGL103W	CTF19	Q02732	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	PEX25	Q02969	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL28	YGL103W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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