RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W-B

YHR213W-B, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W-B, Length 300 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213W-BYHR213W-B YGL041W-AP0C5N3 154 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ENA1P13587 1091 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B UTR1P21373 530 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ADH7P25377 361 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B CHK1P38147 527 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B FMP23P38231 175 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RTC2P38279 296 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YNL208WP40159 199 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B QRI7P43122 407 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PGA1P53896 198 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B APM1Q00776 475 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ENA2Q01896 1091 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GRX5Q02784 150 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SDC1Q03323 175 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SCS7Q03529 384 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YDR179W-AQ03983 463 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MIX14Q04341 121 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YLR346CQ06139 101 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B CDA2Q06703 312 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RDL2Q08742 149 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B BTS1Q12051 335 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SWM1Q12379 170 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YOR343CQ12484 108 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ENA5Q12691 1091 aa5.85□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NFS1P25374 497 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ATS1P31386 333 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data5.84□□□□□ -1.47not detected
YHR213W-BYHR213W-B NDC1P32500 655 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YEF1P32622 495 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ECT1P33412 323 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data5.84□□□□□ -1.47not detected
YHR213W-BYHR213W-B APE4P38821 490 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B AIM10P39965 576 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B IRC5P43610 853 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NUP49Q02199 472 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GRX3Q03835 250 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GSH2Q08220 491 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YOR238WQ08634 303 aa5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NIP7Q08962 181 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MEC1P38111 2368 aa5.84□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YAL064W-BO13512 126 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RAS1P01119 309 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RPB8P20436 146 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B MTC2P34246 357 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B MAL32P38158 584 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B APD1P38281 316 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B SHO1P40073 367 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RPN14P53196 417 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YGR126WP53274 230 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B MAL12P53341 584 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RRN9P53437 365 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B NUP116Q02630 1113 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B SRL4Q03085 281 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YLR173WQ06247 608 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B FMP45Q07651 309 aa5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B THP3Q12049 470 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B CDC9P04819 755 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B CBP6P07253 162 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B FPS1P23900 669 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B STE50P25344 346 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YCL002CP25565 263 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B FUN19P28003 413 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B THI4P32318 326 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B MGE1P38523 228 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PHO90P39535 881 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B VNX1P42839 908 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B SFH5P47008 294 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YGR066CP53242 292 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RCF1Q03713 159 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B GAL83Q04739 417 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B FMP42Q04991 504 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B HRI1Q05905 244 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B IPK1Q06667 281 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B HRT1Q08273 121 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RBD2Q12270 262 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B Q0144Q9ZZW2 109 aa5.82□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B FLO9P39712 1322 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PHO2P07269 559 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B MET2P08465 486 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B SPO7P18410 259 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B CAM1P29547 415 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.81□□□□□ -1.48not detected
YHR213W-BYHR213W-B MRPL16P38064 232 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B DTR1P38125 572 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B SHE1P38200 338 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B NVJ1P38881 321 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B YEL057CP39983 233 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B RFC4P40339 323 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PHB1P40961 287 aa5.81□□□□□ -1.48
YHR213W-BYHR213W-B PFS2P42841 465 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms