RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	PLP1	Q04004	230 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	YMR252C	Q04814	134 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	COA4	Q05809	96 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	TAZ1	Q06510	381 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HDA2	Q06629	674 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	NPC2	Q12408	173 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	MTR10	Q99189	972 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GGA2	YHR108W	HIS3	P06633	220 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SPS2	P08459	502 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SAC7	P17121	654 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	CWP1	P28319	239 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	GPX1	P36014	167 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YKL071W	P36086	256 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	CHK1	P38147	527 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	VPS52	P39904	641 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	LTP1	P40347	161 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YML053C	Q04978	212 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	DIC1	Q06143	298 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YOR378W	Q08902	515 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	GUP2	Q08929	609 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YDL109C	Q12103	647 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MDM32	Q12171	622 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	CDC9	P04819	755 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	COX9	P07255	59 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	DIT1	P21623	536 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	BOS1	P25385	244 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PAU2	P32612	120 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MSS4	P38994	779 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	DOC1	P53068	250 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MRPS16	Q02608	121 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	HLR1	Q04429	423 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	ASR1	Q06834	288 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	ATG41	Q12048	136 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	NUP1	P20676	1076 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PUP1	P25043	261 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MXR2	P25566	168 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	THI4	P32318	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.51	□□□□□ -1.21	not detected
GGA2	YHR108W	MRPL3	P36516	390 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MRPL15	P36523	253 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	FET3	P38993	636 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YPS6	P40583	537 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	AAD14	P42884	376 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SIZ1	Q04195	904 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	AIM6	Q07716	390 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SLC1	P33333	303 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	MRPL16	P38064	232 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	OCA5	P38738	679 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RPP1	P38786	293 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	VNX1	P42839	908 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SAY1	P53324	424 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RSM28	Q03430	361 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YMR130W	Q04223	302 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YPR109W	Q06104	294 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	AVO1	Q08236	1176 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	ENV7	Q12003	364 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	BAG7	Q12128	409 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SOD2	P00447	233 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YCR102C	P25608	368 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PRE4	P30657	266 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	TRS65	P32893	560 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	SFK1	P35735	353 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	NSG1	P38837	291 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YIL152W	P40455	235 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PKP1	P40530	394 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	HXT9	P40885	567 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	BNA6	P43619	295 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	TRM9	P49957	279 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YGR067C	P53243	804 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YLR460C	P54007	376 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	HXT11	P54862	567 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	CYK3	Q07533	885 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YDL129W	Q07555	291 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PET112	P33893	541 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	YKL063C	P35725	167 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GGA2	YHR108W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21

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