RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W SET6Q12529 373 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RHO2P06781 192 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.6□□□□□ -1.83not detected
HCA4YJL033W FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W VMA16P23968 213 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BEM1P29366 551 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NTG1P31378 399 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W AEP1P32493 518 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MRP4P32902 394 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PDR3P33200 976 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BIG1P38813 335 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YIR016WP40572 265 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YIR035CP40579 254 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W VPS25P47142 202 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W AZR1P50080 613 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W AIF1P52923 378 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W INN1P53901 409 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PEX12Q04370 399 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BCH1Q05029 724 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ISN1Q99312 450 aa3.6□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YLR302CO13544 120 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TIM9O74700 87 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YCR101CP25607 182 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CSM1P25651 190 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ATP11P32453 318 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W DOA4P32571 926 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CSE2P33308 149 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SLC1P33333 303 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W IST2P38250 946 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W VAB2P40003 282 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W POP6P53218 158 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W KTR6P54070 446 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NUP49Q02199 472 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TRM12Q04235 462 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SLD7Q08457 257 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NUS1Q12063 375 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UBX3Q12229 455 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GIS3Q12418 502 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CTF3Q12748 733 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MHF1Q3E835 90 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RGS2Q99188 309 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UBR1P19812 1950 aa3.59□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W REP2P03872 296 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SGF29P25554 259 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W URA10P30402 227 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W LDS1P31379 325 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W FUN26P31381 517 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W VMA5P31412 392 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NDC1P32500 655 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SPO23P33757 523 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W FMP23P38231 175 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RMD6P39975 231 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ALT2P52892 507 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RSM27P53305 110 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
HCA4YJL033W ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SPR6Q01684 191 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SMA1Q02651 245 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YMR155WQ03795 547 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W AIM36Q03798 255 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YDR387CQ04162 555 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPR091CQ06833 770 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SCP1Q08873 200 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W IZH4Q99393 312 aa3.59□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W MAS1P10507 462 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W APE1P14904 514 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ERG8P24521 451 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PGS1P25578 521 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PHA2P32452 334 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SCM4P32564 187 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PDC2P32896 925 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ATG12P38316 186 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W LAG1P38703 411 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RBG1P39729 369 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PCL6P40038 420 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W CTK2P46962 323 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W CAC2Q04199 468 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W AEP3Q12089 606 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YLL056CQ12177 298 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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