RNA–Protein interactions for RNA: YGR019W

UGA1, Transcript of Gamma-aminobutyrate (GABA) transaminase, yeast

Gene UGA1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UGA1	YGR019W	SLI1	P53304	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RRN9	P53437	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DID2	P69771	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YAT1	P80235	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SDH1	Q00711	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SPP2	Q02521	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NUP100	Q02629	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PRM15	Q03262	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DCR2	Q05924	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MFG1	Q07684	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	THP1	Q08231	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	BSC6	Q08280	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RDR1	Q08904	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	BTS1	Q12051	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
UGA1	YGR019W	ICT1	Q12385	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ALG7	P07286	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MAS2	P11914	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SPO7	P18410	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SNF5	P18480	905 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	TAF14	P35189	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	AIM29	P36154	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NAT2	P37293	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ARA1	P38115	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YHR033W	P38690	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	STB5	P38699	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GAB1	P41733	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SNG1	P46950	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PRM8	P53174	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YMD8	Q03697	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SMA2	Q04658	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	HRD3	Q05787	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GRX8	Q05926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RRG8	Q06109	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	COS7	Q07788	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	REX4	Q08237	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YNG1	Q08465	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ATP16	Q12165	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MDM32	Q12171	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	INP53	Q12271	1107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PNS1	Q12412	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SNF8	Q12483	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SOD2	P00447	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GAL80	P04387	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GAL3	P13045	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SNF6	P18888	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PEX1	P24004	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PBN1	P25580	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PPA2	P28239	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MNN2	P38069	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	BMT2	P38278	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	LEU5	P38702	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
UGA1	YGR019W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PHM8	P40025	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SPO73	P40031	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MPM1	P40364	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	CIN5	P40917	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MEP2	P41948	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	TIS11	P47977	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	TPN1	P53099	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	VOA1	P53262	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ZRG17	P53735	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	STP1	Q00947	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	HER2	Q03557	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YFT2	Q06676	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	VPS36	Q06696	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	FRE3	Q08905	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
UGA1	YGR019W	SPT3	P06844	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	ZRC1	P20107	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	ADH7	P25377	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	RNP1	P32385	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	JEN1	P36035	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UGA1	YGR019W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected

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