RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G1

tW(CCA)G1, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G1, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PDS5Q04264 1277 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 EDE1P34216 1381 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TOP1P04786 769 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CTT1P06115 562 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RAD4P14736 754 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SER1P33330 395 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DSD1P53095 428 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TAP42Q04372 366 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TEA1P47988 759 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YGL082WP53155 381 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 KIN4Q01919 800 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NYV1Q12255 253 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AUS1Q08409 1394 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YRF1-3P0CX14 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YRF1-7P0CX15 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YRF1-6P53819 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TRK1P12685 1235 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YKL222CP35995 705 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SLI15P38283 698 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ALE1Q08548 619 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SIR4P11978 1358 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FKS3Q04952 1785 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NST1P53935 1240 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NUP145P49687 1317 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ERT1P38140 529 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RMT2Q03305 412 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AOS1Q06624 347 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NOP53Q12080 455 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 APC1P53886 1748 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NTH2P35172 780 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YBR287WP38355 427 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PEX21P50091 288 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CTF4Q01454 927 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 IRC3Q06683 689 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MHP1P43638 1398 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YIL177CP40434 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YJL225CP40889 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 THS1P04801 734 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 KCC4P25389 1037 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YKU70P32807 602 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PFF1P38244 976 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VPS64Q03944 604 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PUS5Q06244 254 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BDF2Q07442 638 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DCD1P06773 312 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ZDS2P54786 942 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ATG20Q07528 640 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PHM7Q12252 991 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FPK1P53739 893 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 AIM7Q12156 149 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ARG8P18544 423 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SIT4P20604 311 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MDG1P53885 366 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ERO1Q03103 563 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SAS4Q04003 481 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 IOC4Q04213 475 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NSE3Q05541 303 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SSP2Q08646 371 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SNF2P22082 1703 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 COQ4O13525 335 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MSM1P22438 575 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SHC1P39000 512 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VHR2P40041 505 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YNL050CP53952 270 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PKH1Q03407 766 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YPR204WQ08995 1032 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PRD1P25375 712 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UGA3P26370 528 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FET4P40988 552 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GSM1P42950 618 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FCP1Q03254 732 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DPL1Q05567 589 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HAT1Q12341 374 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 98.2 ms