RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W YPR204WQ08995 1032 aa5.55□□□□□ -1.52
NTF2YER009W FIG4P42837 879 aa5.54□□□□□ -1.52
NTF2YER009W BDP1P46678 594 aa5.54□□□□□ -1.52
NTF2YER009W VAC17P25591 423 aa5.53□□□□□ -1.52
NTF2YER009W CST6P40535 587 aa5.53□□□□□ -1.52
NTF2YER009W YPP1P46951 817 aa5.53□□□□□ -1.52
NTF2YER009W MCM16Q12262 181 aa5.53□□□□□ -1.52
NTF2YER009W ENO1P00924 437 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W ISF1P32488 338 aa5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W RIM21P48565 533 aa5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W PUS5Q06244 254 aa5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W YPR084WQ06821 456 aa5.52□□□□□ -1.53
NTF2YER009W GUT2P32191 649 aa5.51□□□□□ -1.53
NTF2YER009W EMP47P43555 445 aa5.51□□□□□ -1.53
NTF2YER009W MRX10Q05648 414 aa5.51□□□□□ -1.53
NTF2YER009W STE20Q03497 939 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
NTF2YER009W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.49□□□□□ -1.53not detected
NTF2YER009W KIP2P28743 706 aa5.49□□□□□ -1.53
NTF2YER009W GCR2Q01722 534 aa5.49□□□□□ -1.53
NTF2YER009W FRA1Q07825 749 aa5.49□□□□□ -1.53
NTF2YER009W GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
NTF2YER009W IXR1P33417 597 aa5.48□□□□□ -1.53
NTF2YER009W TTI1P36097 1038 aa5.48□□□□□ -1.53
NTF2YER009W BRE2P43132 505 aa5.48□□□□□ -1.53
NTF2YER009W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
NTF2YER009W CPS1P27614 576 aa5.47□□□□□ -1.53
NTF2YER009W MRX12P47084 519 aa5.47□□□□□ -1.53
NTF2YER009W ITT1Q04638 464 aa5.47□□□□□ -1.53
NTF2YER009W RDS2P19541 446 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
NTF2YER009W ENV9Q08651 330 aa5.46□□□□□ -1.54
NTF2YER009W SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
NTF2YER009W SIS2P36024 562 aa5.45□□□□□ -1.54
NTF2YER009W PEP12P32854 288 aa5.44□□□□□ -1.54
NTF2YER009W ATG3P40344 310 aa5.44□□□□□ -1.54
NTF2YER009W APL6P46682 809 aa5.44□□□□□ -1.54
NTF2YER009W HED1Q03937 162 aa5.44□□□□□ -1.54
NTF2YER009W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
NTF2YER009W APP1P53933 587 aa5.43□□□□□ -1.54
NTF2YER009W SOH1P38633 127 aa5.42□□□□□ -1.54
NTF2YER009W CLA4P48562 842 aa5.42□□□□□ -1.54
NTF2YER009W TGL4P36165 910 aa5.41□□□□□ -1.54
NTF2YER009W KTR7P40504 517 aa5.41□□□□□ -1.54
NTF2YER009W EMW1P42842 904 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
NTF2YER009W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
NTF2YER009W MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
NTF2YER009W ATG20Q07528 640 aa5.4□□□□□ -1.54
NTF2YER009W PUP1P25043 261 aa5.39□□□□□ -1.55
NTF2YER009W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NTF2YER009W CDC4P07834 779 aa5.38□□□□□ -1.55
NTF2YER009W HAL5P38970 855 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
NTF2YER009W AIR1P40507 360 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
NTF2YER009W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
NTF2YER009W MET32Q12041 191 aa5.38□□□□□ -1.55
NTF2YER009W SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
NTF2YER009W MKS1P34072 584 aa5.37□□□□□ -1.55
NTF2YER009W YBL086CP38177 466 aa5.36□□□□□ -1.55
NTF2YER009W ECM23Q02710 187 aa5.36□□□□□ -1.55
NTF2YER009W YML083CQ04526 418 aa5.36□□□□□ -1.55
NTF2YER009W GAL2P13181 574 aa5.35□□□□□ -1.55
NTF2YER009W PHO87P25360 923 aa5.35□□□□□ -1.55
NTF2YER009W FBP26P32604 452 aa5.35□□□□□ -1.55
NTF2YER009W ISU1Q03020 165 aa5.35□□□□□ -1.55
NTF2YER009W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data5.35□□□□□ -1.55not detected
NTF2YER009W MIP1P15801 1254 aa5.34□□□□□ -1.55
NTF2YER009W AFT1P22149 690 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W MET22P32179 357 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W ASH1P34233 588 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W GEF1P37020 779 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W HST3P53687 447 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W DFG5Q05031 458 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W HDA3Q06623 655 aa5.33□□□□□ -1.56
NTF2YER009W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W HAP4P14064 554 aa5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W UTR2P32623 467 aa5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W RTT106P40161 455 aa5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W YFL034WP43564 1073 aa5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W TSC13Q99190 310 aa5.32□□□□□ -1.56
NTF2YER009W STE6P12866 1290 aa5.31□□□□□ -1.56
NTF2YER009W UGA3P26370 528 aa5.31□□□□□ -1.56
NTF2YER009W UBX7P38349 436 aa5.31□□□□□ -1.56
NTF2YER009W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
NTF2YER009W BDS1Q08347 646 aa5.31□□□□□ -1.56
NTF2YER009W DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
NTF2YER009W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
NTF2YER009W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W NTH2P35172 780 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W TBS1P38114 1094 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W SLX8P40072 274 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W ROM1P53046 1155 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W GAS4Q08271 471 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W WTM2Q12206 467 aa5.29□□□□□ -1.56
NTF2YER009W SWI5P08153 709 aa5.27□□□□□ -1.57
NTF2YER009W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
NTF2YER009W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
NTF2YER009W ARG82P07250 355 aa5.26□□□□□ -1.57
NTF2YER009W DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.4 ms