RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
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UBXN8-209ENST00000620074 GGT6Q6P531 493 aa17.14■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 DAPK1P53355 1430 aa17.13■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 NPATQ14207 1427 aa17.12■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.11■□□□□ 0.33
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UBXN8-209ENST00000620074 ZMYM3Q14202 1370 aa17.11■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.11■□□□□ 0.33
UBXN8-209ENST00000620074 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.11■□□□□ 0.33
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UBXN8-209ENST00000620074 ABCC3O15438 1527 aa17.02■□□□□ 0.32
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
UBXN8-209ENST00000620074 NCOA1Q15788 1441 aa17.02■□□□□ 0.31
UBXN8-209ENST00000620074 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
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UBXN8-209ENST00000620074 DEPDC5O75140 1603 aa17■□□□□ 0.31
UBXN8-209ENST00000620074 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.99■□□□□ 0.31
UBXN8-209ENST00000620074 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
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UBXN8-209ENST00000620074 CEP152O94986 1710 aa16.98■□□□□ 0.31
UBXN8-209ENST00000620074 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.96■□□□□ 0.31
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UBXN8-209ENST00000620074 STRCQ7RTU9 1775 aa16.96■□□□□ 0.31
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UBXN8-209ENST00000620074 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.94■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 ROCK1Q13464 1354 aa16.93■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 KANK1Q14678 1352 aa16.93■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.93■□□□□ 0.3
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UBXN8-209ENST00000620074 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.92■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.92■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 PLA2R1Q13018 1463 aa16.92■□□□□ 0.3
UBXN8-209ENST00000620074 NLRP1Q9C000 1473 aa16.92■□□□□ 0.3
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UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.91■□□□□ 0.3
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UBXN8-209ENST00000620074 ITGAEP38570 1179 aa16.84■□□□□ 0.29
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UBXN8-209ENST00000620074 RNF39Q9H2S5 420 aa16.84■□□□□ 0.29
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UBXN8-209ENST00000620074 TET3O43151 1660 aa16.82■□□□□ 0.28
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UBXN8-209ENST00000620074 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.81■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.8■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.79■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.79■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.78■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 NOS1P29475 1434 aa16.78■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.77■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
UBXN8-209ENST00000620074 SYNMO15061 1565 aa16.77■□□□□ 0.27
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UBXN8-209ENST00000620074 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.75■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 NAIPQ13075 1403 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBXN8-209ENST00000620074 MED14O60244 1454 aa16.73■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 FBXO41Q8TF61 875 aa16.73■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 SLIT1O75093 1534 aa16.73■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 NUP155O75694 1391 aa16.73■□□□□ 0.27
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UBXN8-209ENST00000620074 HFM1A2PYH4 1435 aa16.72■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.72■□□□□ 0.27
UBXN8-209ENST00000620074 ADGRB3O60242 1522 aa16.71■□□□□ 0.27
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UBXN8-209ENST00000620074 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.7■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.69■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 IDI1Q13907 227 aa16.69■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.68■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.66■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 EID1Q9Y6B2 187 aa16.65■□□□□ 0.26
UBXN8-209ENST00000620074 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.64■□□□□ 0.25
UBXN8-209ENST00000620074 CPS1P31327 1500 aa16.64■□□□□ 0.25
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