RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615313.4

DDX3X-210, Transcript of DEAD-box helicase 3 X-linked, humanhuman

TSL 4

Gene DDX3X, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3X-210ENST00000615313 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.88■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.88■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.87■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 KIF15Q9NS87 1388 aa29.86■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.85■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 STRCQ7RTU9 1775 aa29.85■■■□□ 2.37
DDX3X-210ENST00000615313 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.82■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.81■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 PZPP20742 1482 aa29.79■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.77■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.77■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.77■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 TNRQ92752 1358 aa29.77■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.77■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 ABCC3O15438 1527 aa29.76■■■□□ 2.36
DDX3X-210ENST00000615313 NCOA1Q15788 1441 aa29.76■■■□□ 2.35
DDX3X-210ENST00000615313 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
DDX3X-210ENST00000615313 ERBINQ96RT1 1412 aa29.74■■■□□ 2.35
DDX3X-210ENST00000615313 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
DDX3X-210ENST00000615313 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.354e-10■□□□□ 8.1
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DDX3X-210ENST00000615313 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.7■■■□□ 2.35
DDX3X-210ENST00000615313 PTPRTO14522 1441 aa29.69■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 CEP152O94986 1710 aa29.68■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 ADGRL2O95490 1459 aa29.67■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 FBXO41Q8TF61 875 aa29.65■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 CERKQ8TCT0 537 aa29.64■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
DDX3X-210ENST00000615313 PLA2R1Q13018 1463 aa29.62■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 ERVK-7P63135 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 PKD2Q13563 968 aa29.6■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 DEPDC5O75140 1603 aa29.6■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 ITGAEP38570 1179 aa29.59■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 KANK1Q14678 1352 aa29.59■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.59■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 NLRP1Q9C000 1473 aa29.58■■■□□ 2.33
DDX3X-210ENST00000615313 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.55■■■□□ 2.32
DDX3X-210ENST00000615313 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.54■■■□□ 2.32
DDX3X-210ENST00000615313 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.322e-8■■□□□ 12.1
DDX3X-210ENST00000615313 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.53■■■□□ 2.32
DDX3X-210ENST00000615313 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
DDX3X-210ENST00000615313 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.51■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.47■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.47■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 ROCK1Q13464 1354 aa29.47■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
DDX3X-210ENST00000615313 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.43■■■□□ 2.3
DDX3X-210ENST00000615313 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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DDX3X-210ENST00000615313 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.37■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 IDI1Q13907 227 aa29.35■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 UNC13BO14795 1591 aa29.35■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 NOS1P29475 1434 aa29.34■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.33■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 SYNMO15061 1565 aa29.33■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 PIK3C2BO00750 1634 aa29.33■■■□□ 2.29
DDX3X-210ENST00000615313 MED14O60244 1454 aa29.32■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 TET3O43151 1660 aa29.3■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 LTKP29376 864 aa29.29■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 NUP155O75694 1391 aa29.28■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.28■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.27■■■□□ 2.28
DDX3X-210ENST00000615313 IQGAP1P46940 1657 aa29.26■■■□□ 2.27
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DDX3X-210ENST00000615313 SLIT1O75093 1534 aa29.25■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.24■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.24■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.24■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 EID1Q9Y6B2 187 aa29.23■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.23■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.23■■■□□ 2.27
DDX3X-210ENST00000615313 E9PCH4 1651 aa29.2■■■□□ 2.26
DDX3X-210ENST00000615313 ADGRB3O60242 1522 aa29.19■■■□□ 2.26
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DDX3X-210ENST00000615313 CPS1P31327 1500 aa29.15■■■□□ 2.26
DDX3X-210ENST00000615313 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.15■■■□□ 2.26
DDX3X-210ENST00000615313 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
DDX3X-210ENST00000615313 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.09■■■□□ 2.25
DDX3X-210ENST00000615313 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
DDX3X-210ENST00000615313 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.08■■■□□ 2.25
DDX3X-210ENST00000615313 HFM1A2PYH4 1435 aa29.07■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.06■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 TRIM52Q96A61 297 aa29.05■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.05■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.04■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 BCANQ96GW7 911 aa29.04■■■□□ 2.24
DDX3X-210ENST00000615313 ZFYVE9O95405 1425 aa29.03■■■□□ 2.24
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