RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597666.5

TIMM50-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, human

TSL 3

Gene TIMM50, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM50-209	ENST00000597666	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TIMM50-209	ENST00000597666	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TIMM50-209	ENST00000597666	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	HSPA2	P54652	639 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TIMM50-209	ENST00000597666	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85
TIMM50-209	ENST00000597666	PZP	P20742	1482 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TIMM50-209	ENST00000597666	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TIMM50-209	ENST00000597666	ABCC3	O15438	1527 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TIMM50-209	ENST00000597666	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TIMM50-209	ENST00000597666	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	KANK1	Q14678	1352 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TIMM50-209	ENST00000597666	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	TNR	Q92752	1358 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	CEP152	O94986	1710 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TIMM50-209	ENST00000597666	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.7	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TIMM50-209	ENST00000597666	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TIMM50-209	ENST00000597666	PTPRT	O14522	1441 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TIMM50-209	ENST00000597666	PKD2	Q13563	968 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TIMM50-209	ENST00000597666	ITGAE	P38570	1179 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	UNC13B	O14795	1591 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
TIMM50-209	ENST00000597666	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TIMM50-209	ENST00000597666	TET3	O43151	1660 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TIMM50-209	ENST00000597666	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	NOS1	P29475	1434 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TIMM50-209	ENST00000597666	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	NUP155	O75694	1391 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	MED14	O60244	1454 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	NAIP	Q13075	1403 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	SYNM	O15061	1565 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TIMM50-209	ENST00000597666	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	SLIT1	O75093	1534 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	IDI1	Q13907	227 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666		E9PCH4	1651 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TIMM50-209	ENST00000597666	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TIMM50-209	ENST00000597666	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TIMM50-209	ENST00000597666	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
TIMM50-209	ENST00000597666	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
TIMM50-209	ENST00000597666	CPS1	P31327	1500 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	LTK	P29376	864 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TIMM50-209	ENST00000597666	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TIMM50-209	ENST00000597666	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.02	■■■□□ 2.72
TIMM50-209	ENST00000597666	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32	■■■□□ 2.71
TIMM50-209	ENST00000597666	TRPM2	O94759	1503 aa		32	■■■□□ 2.71
TIMM50-209	ENST00000597666	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TIMM50-209	ENST00000597666	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71

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