RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.5■■■■■ 4.87
CAPNS1-206ENST00000588815 IQGAP3Q86VI3 1631 aa45.49■■■■■ 4.87
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP155O75694 1391 aa45.46■■■■■ 4.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
CAPNS1-206ENST00000588815 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-206ENST00000588815 REREQ9P2R6 1566 aa45.38■■■■■ 4.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
CAPNS1-206ENST00000588815 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.35■■■■■ 4.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP10AO60312 1499 aa45.31■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.3■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 VWDEQ8N2E2 1590 aa45.3■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.29■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF3BO15066 747 aa45.28■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KANK1Q14678 1352 aa45.26■■■■■ 4.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TET3O43151 1660 aa45.22■■■■■ 4.83
CAPNS1-206ENST00000588815 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.83
CAPNS1-206ENST00000588815 PKD2Q13563 968 aa45.19■■■■■ 4.82
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.19■■■■■ 4.82
CAPNS1-206ENST00000588815 AGLP35573 1532 aa45.18■■■■■ 4.82
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa45.16■■■■■ 4.82
CAPNS1-206ENST00000588815 LMTK2Q8IWU2 1503 aa45.13■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP152O94986 1710 aa45.09■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 SIN3AQ96ST3 1273 aa45.09■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PCH4 1651 aa45.08■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD1Q16676 465 aa45.07■■■■■ 4.81
CAPNS1-206ENST00000588815 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
CAPNS1-206ENST00000588815 NEUROD1Q13562 356 aa45.01■■■■■ 4.8
CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB6Q5THR3 1501 aa45■■■■■ 4.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.97■■■■■ 4.79
CAPNS1-206ENST00000588815 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.97■■■■■ 4.79
CAPNS1-206ENST00000588815 GGT6Q6P531 493 aa44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCC3O15438 1527 aa44.95■■■■■ 4.79
CAPNS1-206ENST00000588815 TONSLQ96HA7 1378 aa44.93■■■■■ 4.78
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.93■■■■■ 4.78
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.92■■■■■ 4.78
CAPNS1-206ENST00000588815 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.86■■■■■ 4.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM2O94759 1503 aa44.84■■■■■ 4.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRTO14522 1441 aa44.84■■■■■ 4.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2R1Q13018 1463 aa44.82■■■■■ 4.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC144AA2RUR9 1427 aa44.81■■■■■ 4.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.79■■■■■ 4.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
CAPNS1-206ENST00000588815 NPATQ14207 1427 aa44.72■■■■■ 4.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CLTCL1P53675 1640 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF1BO60333 1816 aa44.63■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.62■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.6■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 L3MBTL2Q969R5 705 aa44.59■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH2AA6NES4 1674 aa44.58■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NOS1P29475 1434 aa44.57■■■■■ 4.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MLECQ14165 292 aa44.52■■■■■ 4.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3C2BO00750 1634 aa44.51■■■■■ 4.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.47■■■■■ 4.71
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNMO15061 1565 aa44.47■■■■■ 4.71
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa44.46■■■■■ 4.71
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-7P63135 1459 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPNS1-206ENST00000588815 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPNS1-206ENST00000588815 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.36■■■■■ 4.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM3Q14202 1370 aa44.36■■■■■ 4.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC52A1Q9NWF4 448 aa44.35■■■■■ 4.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRB3O60242 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
CAPNS1-206ENST00000588815 STAC3Q96MF2 364 aa44.34■■■■■ 4.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT172Q9UG01 1749 aa44.3■■■■■ 4.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RGL3Q3MIN7 710 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-206ENST00000588815 C3P01024 1663 aa44.26■■■■■ 4.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.23■■■■■ 4.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PPLO60437 1756 aa44.2■■■■■ 4.67
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF8Q3BBV2 869 aa44.19■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.19■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa44.18■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAG1Q86YV5 1406 aa44.17■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MADDQ8WXG6 1647 aa44.17■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IDI1Q13907 227 aa44.15■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa44.15■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOM2P54296 1465 aa44.14■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RALGAPBQ86X10 1494 aa44.14■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.14■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa44.13■■■■■ 4.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa44.07■■■■■ 4.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TNRQ92752 1358 aa44.07■■■■■ 4.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMC1P11047 1609 aa44.02■■■■■ 4.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa44.01■■■■■ 4.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRP1Q9C000 1473 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NRXN1Q9ULB1 1477 aa44■■■■■ 4.63
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