RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.5■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.5■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.5■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.5■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 TMC1Q8TDI8 760 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTIF-205ENST00000587860 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.42■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-205ENST00000587860 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.38■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 KCNA4P22459 653 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.37■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 PLA2R1Q13018 1463 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.36■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 KDM5CP41229 1560 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTIF-205ENST00000587860 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 NBR1Q14596 966 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 PREX2Q70Z35 1606 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 KIF3BO15066 747 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 ABCC2Q92887 1545 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 PANK3Q9H999 370 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 IL27Q8NEV9 243 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-205ENST00000587860 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.27■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 A2MP01023 1474 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 PLCH2O75038 1416 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 TESK2Q96S53 571 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.22■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.22■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.83
CTIF-205ENST00000587860 HOMEZQ8IX15 550 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 NUDCQ9Y266 331 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.19■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 SHROOM2Q13796 1616 aa20.19■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.18■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.18■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 TMF1P82094 1093 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 GGT6Q6P531 493 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CTIF-205ENST00000587860 RALBP1Q15311 655 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 PLIN1O60240 522 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 NLRP13Q86W25 1043 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 ERBINQ96RT1 1412 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.1■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.09■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 FANCAO15360 1455 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-205ENST00000587860 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.08■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 SKAP1Q86WV1 359 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 ABCC1P33527 1531 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 UNC13BO14795 1591 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 RAPGEF3O95398 923 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 ASXL2Q76L83 1435 aa20.02■□□□□ 0.8
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