RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.13■■■□□ 2.57
CTIF-205ENST00000587860 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
CTIF-205ENST00000587860 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.81■■□□□ 1.88
CTIF-205ENST00000587860 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CTIF-205ENST00000587860 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTIF-205ENST00000587860 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.16■■□□□ 1.78
CTIF-205ENST00000587860 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.43■■□□□ 1.66
CTIF-205ENST00000587860 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
CTIF-205ENST00000587860 ABCC9O60706 1549 aa25.19■■□□□ 1.62
CTIF-205ENST00000587860 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.15■■□□□ 1.62
CTIF-205ENST00000587860 SCRIBQ14160 1630 aa25.09■■□□□ 1.61
CTIF-205ENST00000587860 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.01■■□□□ 1.59
CTIF-205ENST00000587860 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.83■■□□□ 1.57
CTIF-205ENST00000587860 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.75■■□□□ 1.55
CTIF-205ENST00000587860 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTIF-205ENST00000587860 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTIF-205ENST00000587860 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.61■■□□□ 1.53
CTIF-205ENST00000587860 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTIF-205ENST00000587860 TRIM41Q8WV44 630 aa24.53■■□□□ 1.52
CTIF-205ENST00000587860 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.47■■□□□ 1.51
CTIF-205ENST00000587860 SLC24A1O60721 1099 aa24.44■■□□□ 1.5
CTIF-205ENST00000587860 NACADO15069 1562 aa24.39■■□□□ 1.49
CTIF-205ENST00000587860 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.38■■□□□ 1.49
CTIF-205ENST00000587860 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CTIF-205ENST00000587860 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTIF-205ENST00000587860 HRCP23327 699 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-205ENST00000587860 WIZO95785 1651 aa24.23■■□□□ 1.47
CTIF-205ENST00000587860 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTIF-205ENST00000587860 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTIF-205ENST00000587860 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CTIF-205ENST00000587860 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-205ENST00000587860 ABCC8Q09428 1581 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-205ENST00000587860 MYT1Q01538 1121 aa23.77■■□□□ 1.4
CTIF-205ENST00000587860 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.74■■□□□ 1.39
CTIF-205ENST00000587860 SMARCA4P51532 1647 aa23.7■■□□□ 1.39
CTIF-205ENST00000587860 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTIF-205ENST00000587860 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.57■■□□□ 1.36
CTIF-205ENST00000587860 SOGA1O94964 1423 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-205ENST00000587860 SMARCA2P51531 1590 aa23.56■■□□□ 1.36
CTIF-205ENST00000587860 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTIF-205ENST00000587860 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTIF-205ENST00000587860 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTIF-205ENST00000587860 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
CTIF-205ENST00000587860 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTIF-205ENST00000587860 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.36■■□□□ 1.33
CTIF-205ENST00000587860 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.26■■□□□ 1.31
CTIF-205ENST00000587860 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.319e-6■■■■■ 50.1
CTIF-205ENST00000587860 CEP162Q5TB80 1403 aa23.23■■□□□ 1.31
CTIF-205ENST00000587860 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTIF-205ENST00000587860 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTIF-205ENST00000587860 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CTIF-205ENST00000587860 SYNJ1O43426 1573 aa23.1■■□□□ 1.29
CTIF-205ENST00000587860 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.06■■□□□ 1.28
CTIF-205ENST00000587860 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.01■■□□□ 1.27
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA3Q08378 1498 aa22.95■■□□□ 1.26
CTIF-205ENST00000587860 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.91■■□□□ 1.26
CTIF-205ENST00000587860 EEA1Q15075 1411 aa22.9■■□□□ 1.26
CTIF-205ENST00000587860 CLIP1P30622 1438 aa22.85■■□□□ 1.25
CTIF-205ENST00000587860 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
CTIF-205ENST00000587860 APLP2Q06481 763 aa22.8■■□□□ 1.24
CTIF-205ENST00000587860 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CTIF-205ENST00000587860 NCAPD3P42695 1498 aa22.7■■□□□ 1.22
CTIF-205ENST00000587860 CUX1P39880 1505 aa22.64■■□□□ 1.22
CTIF-205ENST00000587860 TOP2BQ02880 1626 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 KIF21BO75037 1637 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 ITGAEP38570 1179 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 NEUROD1Q13562 356 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CTIF-205ENST00000587860 P3H3Q8IVL6 736 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 HMGXB3Q12766 1538 aa22.53■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 CFTRP13569 1480 aa22.52■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.52■■□□□ 1.2
CTIF-205ENST00000587860 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTIF-205ENST00000587860 BCL11AQ9H165 835 aa22.51■■□□□ 1.19
CTIF-205ENST00000587860 KIF27Q86VH2 1401 aa22.49■■□□□ 1.19
CTIF-205ENST00000587860 PRXQ9BXM0 1461 aa22.46■■□□□ 1.19
CTIF-205ENST00000587860 CUX2O14529 1486 aa22.46■■□□□ 1.19
CTIF-205ENST00000587860 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.45■■□□□ 1.18
CTIF-205ENST00000587860 ARAP1Q96P48 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-205ENST00000587860 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-205ENST00000587860 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-205ENST00000587860 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTIF-205ENST00000587860 NESP48681 1621 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-205ENST00000587860 IGF1RP08069 1367 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTIF-205ENST00000587860 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-205ENST00000587860 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.3■■□□□ 1.16
CTIF-205ENST00000587860 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.27■■□□□ 1.16
CTIF-205ENST00000587860 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.26■■□□□ 1.15
CTIF-205ENST00000587860 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-205ENST00000587860 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-205ENST00000587860 MIER1Q8N108 512 aa22.19■■□□□ 1.14
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