RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 MROH2AA6NES4 1674 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-204ENST00000587769 GGT6Q6P531 493 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 ZMYM3Q14202 1370 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 HFM1A2PYH4 1435 aa16.36■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 ERBINQ96RT1 1412 aa16.36■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 STRCQ7RTU9 1775 aa16.36■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 NAIPQ13075 1403 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-204ENST00000587769 KIF3BO15066 747 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 NPATQ14207 1427 aa16.29■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 DEPDC5O75140 1603 aa16.27■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 UNC13BO14795 1591 aa16.27■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CTIF-204ENST00000587769 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.27■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.24■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.23■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-204ENST00000587769 FBXO41Q8TF61 875 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 CEP152O94986 1710 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 ABCC3O15438 1527 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 KANK1Q14678 1352 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 PTPRTO14522 1441 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 PZPP20742 1482 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 CERKQ8TCT0 537 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.16■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 NUP155O75694 1391 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 TNRQ92752 1358 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTIF-204ENST00000587769 TET3O43151 1660 aa16.14■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.14■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 HRCP23327 699 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 TRIM52Q96A61 297 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 PLA2R1Q13018 1463 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 PKD2Q13563 968 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-204ENST00000587769 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 NLRP1Q9C000 1473 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 E9PCH4 1651 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 ERVK-7P63135 1459 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-204ENST00000587769 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 NOS1P29475 1434 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 SYNMO15061 1565 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 TRPM2O94759 1503 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 PIK3C2BO00750 1634 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-204ENST00000587769 MED14O60244 1454 aa15.96■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 IQGAP1P46940 1657 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 IDI1Q13907 227 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 FOXD1Q16676 465 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 LTKP29376 864 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 CLTCL1P53675 1640 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 SLIT1O75093 1534 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-204ENST00000587769 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 301.8 ms