RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586065.1

PTPRS-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-203ENST00000586065 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 A2MP01023 1474 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 PTPRKQ15262 1439 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-203ENST00000586065 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PTPRS-203ENST00000586065 ADGRL2O95490 1459 aa22■■□□□ 1.11
PTPRS-203ENST00000586065 C3P01024 1663 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRS-203ENST00000586065 TSPY4P0CV99 314 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 TSPY10P0CW01 314 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 ZMYM3Q14202 1370 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 KIF15Q9NS87 1388 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRS-203ENST00000586065 HSPA1LP34931 641 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 NPATQ14207 1427 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 ERBINQ96RT1 1412 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 PIP4K2BP78356 416 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 PKD2Q13563 968 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 ROCK1Q13464 1354 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 DEPDC5O75140 1603 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 ITGAEP38570 1179 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRS-203ENST00000586065 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 MROH2AA6NES4 1674 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 GGT6Q6P531 493 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 KIF3BO15066 747 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 PLA2R1Q13018 1463 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRS-203ENST00000586065 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 UNC13BO14795 1591 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC3O15438 1527 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 CEP152O94986 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 TOM1O60784 492 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 NAIPQ13075 1403 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 HFM1A2PYH4 1435 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRS-203ENST00000586065 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRS-203ENST00000586065 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRS-203ENST00000586065 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-203ENST00000586065 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRS-203ENST00000586065 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRS-203ENST00000586065 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 PZPP20742 1482 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 TET3O43151 1660 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 CPS1P31327 1500 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRS-203ENST00000586065 KANK1Q14678 1352 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 TNRQ92752 1358 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 ERVK-7P63135 1459 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 E9PCH4 1651 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 ALKQ9UM73 1620 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-203ENST00000586065 SYNMO15061 1565 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 NUP155O75694 1391 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 NOS1P29475 1434 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRS-203ENST00000586065 MED14O60244 1454 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 PIK3C2BO00750 1634 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 NLRP1Q9C000 1473 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRS-203ENST00000586065 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 POTEAQ6S8J7 498 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 TRIM52Q96A61 297 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 TRPM2O94759 1503 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 ADGRB3O60242 1522 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRS-203ENST00000586065 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
PTPRS-203ENST00000586065 CLTCL1P53675 1640 aa21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms