RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa47.34■■■■■ 5.17
GIPC1-205ENST00000586027 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.33■■■■■ 5.17
GIPC1-205ENST00000586027 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
GIPC1-205ENST00000586027 DEPDC5O75140 1603 aa47.29■■■■■ 5.16
GIPC1-205ENST00000586027 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 PPP6R1Q9UPN7 881 aa47.24■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP47.23■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 PTPRMP28827 1452 aa47.21■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
GIPC1-205ENST00000586027 KDM5DQ9BY66 1539 aa47.19■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 CNTLNQ9NXG0 1405 aa47.18■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa47.17■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 UNC13BO14795 1591 aa47.16■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC3O15438 1527 aa47.16■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 FAM135AQ9P2D6 1515 aa47.15■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 VWDEQ8N2E2 1590 aa47.14■■■■■ 5.14
GIPC1-205ENST00000586027 SETD5Q9C0A6 1442 aa47.1■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP47.1■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 CEP152O94986 1710 aa47.09■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 MROH2AA6NES4 1674 aa47.09■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 ZMYM3Q14202 1370 aa47.08■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 KANK1Q14678 1352 aa47.08■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.07■■■■■ 5.13
GIPC1-205ENST00000586027 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.12
GIPC1-205ENST00000586027 C3P01024 1663 aa47.04■■■■■ 5.12
GIPC1-205ENST00000586027 NUP155O75694 1391 aa47.02■■■■■ 5.12
GIPC1-205ENST00000586027 LMTK2Q8IWU2 1503 aa47■■■■■ 5.12
GIPC1-205ENST00000586027 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.98■■■■■ 5.11
GIPC1-205ENST00000586027 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa46.97■■■■■ 5.11
GIPC1-205ENST00000586027 IQGAP3Q86VI3 1631 aa46.96■■■■■ 5.11
GIPC1-205ENST00000586027 PZPP20742 1482 aa46.91■■■■■ 5.1
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM52Q96A61 297 aa46.89■■■■■ 5.1
GIPC1-205ENST00000586027 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.87■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.87■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 NPATQ14207 1427 aa46.86■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 TET3O43151 1660 aa46.85■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
GIPC1-205ENST00000586027 ERVK-7P63135 1459 aa46.75■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 E9PCH4 1651 aa46.73■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 HRCP23327 699 aa46.73■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa46.71■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.7■■■■■ 5.07
GIPC1-205ENST00000586027 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
GIPC1-205ENST00000586027 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
GIPC1-205ENST00000586027 TNRQ92752 1358 aa46.67■■■■■ 5.06
GIPC1-205ENST00000586027 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
GIPC1-205ENST00000586027 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.64■■■■■ 5.06
GIPC1-205ENST00000586027 NOS1P29475 1434 aa46.63■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.62■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 PKD2Q13563 968 aa46.61■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 MYO3AQ8NEV4 1616 aa46.58■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 SYNMO15061 1565 aa46.57■■■■■ 5.05
GIPC1-205ENST00000586027 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46.54■■■■■ 5.04
GIPC1-205ENST00000586027 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.54■■■■■ 5.04
GIPC1-205ENST00000586027 FOXD1Q16676 465 aa46.52■■■■■ 5.04
GIPC1-205ENST00000586027 PTPRTO14522 1441 aa46.48■■■■■ 5.03
GIPC1-205ENST00000586027 NLRP1Q9C000 1473 aa46.47■■■■■ 5.03
GIPC1-205ENST00000586027 PLA2R1Q13018 1463 aa46.45■■■■■ 5.03
GIPC1-205ENST00000586027 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.03
GIPC1-205ENST00000586027 UGGT1Q9NYU2 1555 aa46.43■■■■■ 5.02
GIPC1-205ENST00000586027 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa46.43■■■■■ 5.02
GIPC1-205ENST00000586027 A2ML1A8K2U0 1454 aa46.43■■■■■ 5.02
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP46.42■■■■■ 5.02
GIPC1-205ENST00000586027 IDI1Q13907 227 aa46.4■■■■■ 5.02
GIPC1-205ENST00000586027 HSPA2P54652 639 aa46.36■■■■■ 5.01
GIPC1-205ENST00000586027 TRPM2O94759 1503 aa46.36■■■■■ 5.01
GIPC1-205ENST00000586027 PIK3C2BO00750 1634 aa46.36■■■■■ 5.01
GIPC1-205ENST00000586027 SLC52A1Q9NWF4 448 aa46.35■■■■■ 5.01
GIPC1-205ENST00000586027 CLTCL1P53675 1640 aa46.27■■■■■ 5
GIPC1-205ENST00000586027 UBR1Q8IWV7 1749 aa46.25■■■■■ 4.99
GIPC1-205ENST00000586027 ADGRB3O60242 1522 aa46.21■■■■■ 4.99
GIPC1-205ENST00000586027 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
GIPC1-205ENST00000586027 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.19■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa46.16■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 STAG3Q9UJ98 1225 aa46.16■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 CHGAP10645 457 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.13■■■■■ 4.98
GIPC1-205ENST00000586027 MYO5BQ9ULV0 1848 aa46.09■■■■■ 4.97
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP23Q9P227 1491 aa46.05■■■■■ 4.96
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM2Q9UHN6 1383 aa46.04■■■■■ 4.96
GIPC1-205ENST00000586027 SLIT1O75093 1534 aa46.04■■■■■ 4.96
GIPC1-205ENST00000586027 STRCQ7RTU9 1775 aa46.01■■■■■ 4.96
GIPC1-205ENST00000586027 KIF1BO60333 1816 aa46■■■■■ 4.95
GIPC1-205ENST00000586027 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa46■■■■■ 4.95
GIPC1-205ENST00000586027 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa45.95■■■■■ 4.95
GIPC1-205ENST00000586027 LTKP29376 864 aa45.95■■■■■ 4.95
GIPC1-205ENST00000586027 ZFYVE9O95405 1425 aa45.94■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 ANKLE2Q86XL3 938 aa45.93■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 RIMS2Q9UQ26 1411 aa45.92■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 NEURL4Q96JN8 1562 aa45.9■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 TXNDC2Q86VQ3 553 aa45.89■■■■■ 4.94
GIPC1-205ENST00000586027 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms