RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574941.5

TRAP1-211, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-211ENST00000574941 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAP1-211ENST00000574941 ERBINQ96RT1 1412 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAP1-211ENST00000574941 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
TRAP1-211ENST00000574941 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
TRAP1-211ENST00000574941 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 ZMYM3Q14202 1370 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 C3P01024 1663 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 MROH2AA6NES4 1674 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAP1-211ENST00000574941 ROCK1Q13464 1354 aa29.89■■■□□ 2.37
TRAP1-211ENST00000574941 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAP1-211ENST00000574941 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAP1-211ENST00000574941 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAP1-211ENST00000574941 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.375e-7■□□□□ 10.5
TRAP1-211ENST00000574941 ABCC3O15438 1527 aa29.82■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.81■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 NPATQ14207 1427 aa29.79■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 DEPDC5O75140 1603 aa29.78■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 KANK1Q14678 1352 aa29.77■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
TRAP1-211ENST00000574941 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.76■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.75■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 PZPP20742 1482 aa29.74■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 HSPA2P54652 639 aa29.73■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 CEP152O94986 1710 aa29.73■■■□□ 2.35
TRAP1-211ENST00000574941 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.68■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 TNRQ92752 1358 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 NAIPQ13075 1403 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.64■■■□□ 2.34
TRAP1-211ENST00000574941 UNC13BO14795 1591 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 HFM1A2PYH4 1435 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 ERVK-7P63135 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAP1-211ENST00000574941 NUP155O75694 1391 aa29.57■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.56■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.54■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
TRAP1-211ENST00000574941 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 TET3O43151 1660 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 NLRP1Q9C000 1473 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 TRIM52Q96A61 297 aa29.45■■■□□ 2.31
TRAP1-211ENST00000574941 NOS1P29475 1434 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAP1-211ENST00000574941 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAP1-211ENST00000574941 SYNMO15061 1565 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAP1-211ENST00000574941 E9PCH4 1651 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAP1-211ENST00000574941 STRCQ7RTU9 1775 aa29.39■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 PLA2R1Q13018 1463 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.37■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 IDI1Q13907 227 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAP1-211ENST00000574941 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 PIK3C2BO00750 1634 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 PKD2Q13563 968 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.3■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 PTPRTO14522 1441 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAP1-211ENST00000574941 ADGRB3O60242 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAP1-211ENST00000574941 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TRAP1-211ENST00000574941 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 SLIT1O75093 1534 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 FOXD1Q16676 465 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 EID1Q9Y6B2 187 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 LTKP29376 864 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 TRPM2O94759 1503 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAP1-211ENST00000574941 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAP1-211ENST00000574941 MED14O60244 1454 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAP1-211ENST00000574941 CLTCL1P53675 1640 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAP1-211ENST00000574941 HRCP23327 699 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAP1-211ENST00000574941 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAP1-211ENST00000574941 IQGAP1P46940 1657 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAP1-211ENST00000574941 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAP1-211ENST00000574941 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TRAP1-211ENST00000574941 ZFYVE9O95405 1425 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAP1-211ENST00000574941 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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