RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568076.6

CLN3-230, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-230ENST00000568076 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 ASXL2Q76L83 1435 aa28.2■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 OSCARQ8IYS5 282 aa28.2■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
CLN3-230ENST00000568076 FANCAO15360 1455 aa28.19■■■□□ 2.1
CLN3-230ENST00000568076 ATP10AO60312 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN3-230ENST00000568076 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN3-230ENST00000568076 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.11■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 A2MP01023 1474 aa28.11■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 ADGRL1O94910 1474 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 RGL3Q3MIN7 710 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 ATP7AQ04656 1500 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN3-230ENST00000568076 CCDC184Q52MB2 194 aa28.08■■■□□ 2.09
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CLN3-230ENST00000568076 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.07■■■□□ 2.08
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CLN3-230ENST00000568076 DEPDC5O75140 1603 aa28.05■■■□□ 2.08
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CLN3-230ENST00000568076 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.04■■■□□ 2.08
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CLN3-230ENST00000568076 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CLN3-230ENST00000568076 MRS2Q9HD23 443 aa27.92■■■□□ 2.06
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CLN3-230ENST00000568076 NEFLP07196 543 aa27.69■■■□□ 2.02
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CLN3-230ENST00000568076 TMF1P82094 1093 aa27.63■■■□□ 2.01
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CLN3-230ENST00000568076 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.58■■■□□ 2.01
CLN3-230ENST00000568076 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CLN3-230ENST00000568076 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.57■■■□□ 2
CLN3-230ENST00000568076 IFT172Q9UG01 1749 aa27.57■■■□□ 2
CLN3-230ENST00000568076 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.55■■■□□ 2
CLN3-230ENST00000568076 PANK3Q9H999 370 aa27.55■■■□□ 2
CLN3-230ENST00000568076 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.55■■■□□ 2
CLN3-230ENST00000568076 ABCC3O15438 1527 aa27.54■■■□□ 2
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