RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567087.5

PKM-218, Transcript of pyruvate kinase M1/2, humanhuman

TSL 4

Gene PKM, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKM-218ENST00000567087 PTPRKQ15262 1439 aa28.7■■■□□ 2.19
PKM-218ENST00000567087 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.7■■■□□ 2.19
PKM-218ENST00000567087 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.69■■■□□ 2.18
PKM-218ENST00000567087 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PKM-218ENST00000567087 KIF15Q9NS87 1388 aa28.68■■■□□ 2.18
PKM-218ENST00000567087 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
PKM-218ENST00000567087 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PKM-218ENST00000567087 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.63■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.63■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.62■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 ERBINQ96RT1 1412 aa28.62■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 PZPP20742 1482 aa28.62■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.62■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.58■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 ABCC3O15438 1527 aa28.58■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PKM-218ENST00000567087 TNRQ92752 1358 aa28.57■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 NCOA1Q15788 1441 aa28.56■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 STRCQ7RTU9 1775 aa28.56■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.54■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.54■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.52■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 ADGRL2O95490 1459 aa28.52■■■□□ 2.16
PKM-218ENST00000567087 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 PTPRTO14522 1441 aa28.51■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 PLA2R1Q13018 1463 aa28.48■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 KANK1Q14678 1352 aa28.48■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 CEP152O94986 1710 aa28.46■■■□□ 2.15
PKM-218ENST00000567087 DEPDC5O75140 1603 aa28.45■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 NLRP1Q9C000 1473 aa28.45■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 ERVK-7P63135 1459 aa28.42■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 PKD2Q13563 968 aa28.42■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.41■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 FBXO41Q8TF61 875 aa28.41■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.41■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.4■■■□□ 2.14
PKM-218ENST00000567087 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.38■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 CERKQ8TCT0 537 aa28.38■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.36■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 ROCK1Q13464 1354 aa28.35■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
PKM-218ENST00000567087 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.33■■■□□ 2.12
PKM-218ENST00000567087 ITGAEP38570 1179 aa28.32■■■□□ 2.12
PKM-218ENST00000567087 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.27■■■□□ 2.12
PKM-218ENST00000567087 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
PKM-218ENST00000567087 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.26■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.22■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.22■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 UNC13BO14795 1591 aa28.21■■■□□ 2.11
PKM-218ENST00000567087 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.18■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 TET3O43151 1660 aa28.16■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.16■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 MED14O60244 1454 aa28.15■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 NOS1P29475 1434 aa28.15■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
PKM-218ENST00000567087 SYNMO15061 1565 aa28.13■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 PIK3C2BO00750 1634 aa28.13■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.11■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 IQGAP1P46940 1657 aa28.1■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 SLIT1O75093 1534 aa28.1■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.1■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 NUP155O75694 1391 aa28.1■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 IDI1Q13907 227 aa28.09■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.09■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.08■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 EID1Q9Y6B2 187 aa28.08■■■□□ 2.09
PKM-218ENST00000567087 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PKM-218ENST00000567087 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.06■■■□□ 2.08
PKM-218ENST00000567087 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.06■■■□□ 2.08
PKM-218ENST00000567087 ADGRB3O60242 1522 aa28.06■■■□□ 2.08
PKM-218ENST00000567087 CPS1P31327 1500 aa28.04■■■□□ 2.08
PKM-218ENST00000567087 LTKP29376 864 aa28.01■■■□□ 2.07
PKM-218ENST00000567087 E9PCH4 1651 aa28■■■□□ 2.07
PKM-218ENST00000567087 NAIPQ13075 1403 aa28■■■□□ 2.07
PKM-218ENST00000567087 HFM1A2PYH4 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
PKM-218ENST00000567087 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.92■■■□□ 2.06
PKM-218ENST00000567087 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PKM-218ENST00000567087 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PKM-218ENST00000567087 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.89■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.86■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 TRIM52Q96A61 297 aa27.86■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 BCANQ96GW7 911 aa27.85■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 ZFYVE9O95405 1425 aa27.84■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.83■■■□□ 2.05
PKM-218ENST00000567087 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.83■■■□□ 2.05
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