RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-218	ENST00000566180	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RNPS1-218	ENST00000566180	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNPS1-218	ENST00000566180	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RNPS1-218	ENST00000566180	PZP	P20742	1482 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RNPS1-218	ENST00000566180	ABCC3	O15438	1527 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RNPS1-218	ENST00000566180	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RNPS1-218	ENST00000566180	TNR	Q92752	1358 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.75	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.72	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
RNPS1-218	ENST00000566180	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	KANK1	Q14678	1352 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RNPS1-218	ENST00000566180	PTPRT	O14522	1441 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	ITGAE	P38570	1179 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	PKD2	Q13563	968 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	CEP152	O94986	1710 aa		32.57	■■■□□ 2.81
RNPS1-218	ENST00000566180	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RNPS1-218	ENST00000566180	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RNPS1-218	ENST00000566180	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RNPS1-218	ENST00000566180	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RNPS1-218	ENST00000566180	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RNPS1-218	ENST00000566180	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RNPS1-218	ENST00000566180	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RNPS1-218	ENST00000566180	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RNPS1-218	ENST00000566180	NOS1	P29475	1434 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RNPS1-218	ENST00000566180	UNC13B	O14795	1591 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RNPS1-218	ENST00000566180	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
RNPS1-218	ENST00000566180	IDI1	Q13907	227 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RNPS1-218	ENST00000566180	NUP155	O75694	1391 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RNPS1-218	ENST00000566180	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	NAIP	Q13075	1403 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	TET3	O43151	1660 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	MED14	O60244	1454 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	SYNM	O15061	1565 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RNPS1-218	ENST00000566180	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	SLIT1	O75093	1534 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	LTK	P29376	864 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
RNPS1-218	ENST00000566180	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RNPS1-218	ENST00000566180	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RNPS1-218	ENST00000566180		E9PCH4	1651 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RNPS1-218	ENST00000566180	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RNPS1-218	ENST00000566180	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RNPS1-218	ENST00000566180	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RNPS1-218	ENST00000566180	CPS1	P31327	1500 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RNPS1-218	ENST00000566180	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RNPS1-218	ENST00000566180	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RNPS1-218	ENST00000566180	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RNPS1-218	ENST00000566180	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RNPS1-218	ENST00000566180	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RNPS1-218	ENST00000566180	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
RNPS1-218	ENST00000566180	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RNPS1-218	ENST00000566180	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RNPS1-218	ENST00000566180	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7

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