RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 NPATQ14207 1427 aa30.66■■■□□ 2.5
CMTM3-211ENST00000565922 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.66■■■□□ 2.5
CMTM3-211ENST00000565922 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CMTM3-211ENST00000565922 KIF15Q9NS87 1388 aa30.62■■■□□ 2.49
CMTM3-211ENST00000565922 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CMTM3-211ENST00000565922 ERBINQ96RT1 1412 aa30.6■■■□□ 2.49
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.59■■■□□ 2.49
CMTM3-211ENST00000565922 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.56■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 HSPA2P54652 639 aa30.55■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 ADGRL2O95490 1459 aa30.55■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 PTPRKQ15262 1439 aa30.55■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.53■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.53■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.52■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CMTM3-211ENST00000565922 NCOA1Q15788 1441 aa30.51■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 PZPP20742 1482 aa30.5■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 DEPDC5O75140 1603 aa30.5■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 CEP152O94986 1710 aa30.5■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 ABCC3O15438 1527 aa30.49■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.49■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.45■■■□□ 2.47
CMTM3-211ENST00000565922 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CMTM3-211ENST00000565922 STRCQ7RTU9 1775 aa30.43■■■□□ 2.46
CMTM3-211ENST00000565922 KANK1Q14678 1352 aa30.4■■■□□ 2.46
CMTM3-211ENST00000565922 TNRQ92752 1358 aa30.38■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 ROCK1Q13464 1354 aa30.37■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.36■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.36■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.35■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.34■■■□□ 2.45
CMTM3-211ENST00000565922 NLRP1Q9C000 1473 aa30.32■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.31■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 PLA2R1Q13018 1463 aa30.31■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.3■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.3■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 ERVK-7P63135 1459 aa30.29■■■□□ 2.44
CMTM3-211ENST00000565922 UNC13BO14795 1591 aa30.25■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 PTPRTO14522 1441 aa30.25■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 ITGAEP38570 1179 aa30.25■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.22■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.22■■■□□ 2.43
CMTM3-211ENST00000565922 PKD2Q13563 968 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM3-211ENST00000565922 TET3O43151 1660 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM3-211ENST00000565922 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.19■■■□□ 2.42
CMTM3-211ENST00000565922 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CMTM3-211ENST00000565922 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CMTM3-211ENST00000565922 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.14■■■□□ 2.41
CMTM3-211ENST00000565922 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.13■■■□□ 2.41
CMTM3-211ENST00000565922 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.11■■■□□ 2.41
CMTM3-211ENST00000565922 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CMTM3-211ENST00000565922 PIK3C2BO00750 1634 aa30.07■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 NOS1P29475 1434 aa30.05■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.05■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 SYNMO15061 1565 aa30.05■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 E9PCH4 1651 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 NUP155O75694 1391 aa30.02■■■□□ 2.4
CMTM3-211ENST00000565922 NAIPQ13075 1403 aa30.01■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 CERKQ8TCT0 537 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 MED14O60244 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 IQGAP1P46940 1657 aa29.98■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 HFM1A2PYH4 1435 aa29.98■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 SLIT1O75093 1534 aa29.97■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.97■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.97■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 FBXO41Q8TF61 875 aa29.96■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.96■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 ADGRB3O60242 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.94■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 IDI1Q13907 227 aa29.92■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.89■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.89■■■□□ 2.38
CMTM3-211ENST00000565922 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.88■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 EID1Q9Y6B2 187 aa29.88■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.88■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.83■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.83■■■□□ 2.37
CMTM3-211ENST00000565922 CPS1P31327 1500 aa29.81■■■□□ 2.36
CMTM3-211ENST00000565922 LTKP29376 864 aa29.78■■■□□ 2.36
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM52Q96A61 297 aa29.77■■■□□ 2.36
CMTM3-211ENST00000565922 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CMTM3-211ENST00000565922 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CMTM3-211ENST00000565922 TRPM2O94759 1503 aa29.72■■■□□ 2.35
CMTM3-211ENST00000565922 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CMTM3-211ENST00000565922 KIF1BO60333 1816 aa29.71■■■□□ 2.35
CMTM3-211ENST00000565922 ZFYVE9O95405 1425 aa29.7■■■□□ 2.34
CMTM3-211ENST00000565922 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms