RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 NUP155O75694 1391 aa35.11■■■■□ 3.21
MEIS3-204ENST00000558555 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.09■■■■□ 3.21
MEIS3-204ENST00000558555 KIF3BO15066 747 aa35.09■■■■□ 3.21
MEIS3-204ENST00000558555 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
MEIS3-204ENST00000558555 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.06■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.06■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 DEPDC5O75140 1603 aa35.06■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.05■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.05■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 REREQ9P2R6 1566 aa35.05■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 PZPP20742 1482 aa35.04■■■■□ 3.2
MEIS3-204ENST00000558555 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 KANK1Q14678 1352 aa35■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.99■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.97■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
MEIS3-204ENST00000558555 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.94■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 AGLP35573 1532 aa34.93■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 GGT6Q6P531 493 aa34.9■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.9■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 MADDQ8WXG6 1647 aa34.89■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 PKD2Q13563 968 aa34.89■■■■□ 3.18
MEIS3-204ENST00000558555 MLECQ14165 292 aa34.87■■■■□ 3.17
MEIS3-204ENST00000558555 TET3O43151 1660 aa34.83■■■■□ 3.17
MEIS3-204ENST00000558555 FOXD1Q16676 465 aa34.83■■■■□ 3.17
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRMP28827 1452 aa34.81■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 CEP152O94986 1710 aa34.8■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.79■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.77■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.76■■■■□ 3.16
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC3O15438 1527 aa34.75■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.74■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 E9PCH4 1651 aa34.73■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.72■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.72■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.71■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 NEUROD1Q13562 356 aa34.7■■■■□ 3.15
MEIS3-204ENST00000558555 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.69■■■■□ 3.14
MEIS3-204ENST00000558555 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.67■■■■□ 3.14
MEIS3-204ENST00000558555 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
MEIS3-204ENST00000558555 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
MEIS3-204ENST00000558555 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.61■■■■□ 3.13
MEIS3-204ENST00000558555 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.57■■■■□ 3.13
MEIS3-204ENST00000558555 NPATQ14207 1427 aa34.57■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.56■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 PLA2R1Q13018 1463 aa34.56■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.55■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRTO14522 1441 aa34.55■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 TONSLQ96HA7 1378 aa34.54■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 TRPM2O94759 1503 aa34.54■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
MEIS3-204ENST00000558555 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.51■■■■□ 3.11
MEIS3-204ENST00000558555 MROH2AA6NES4 1674 aa34.44■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.43■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 NOS1P29475 1434 aa34.42■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 CLTCL1P53675 1640 aa34.41■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.41■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 ZMYM3Q14202 1370 aa34.4■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 C3P01024 1663 aa34.39■■■■□ 3.1
MEIS3-204ENST00000558555 ERVK-7P63135 1459 aa34.36■■■■□ 3.09
MEIS3-204ENST00000558555 SYNMO15061 1565 aa34.34■■■■□ 3.09
MEIS3-204ENST00000558555 KIF1BO60333 1816 aa34.33■■■■□ 3.09
MEIS3-204ENST00000558555 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.33■■■■□ 3.09
MEIS3-204ENST00000558555 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.33■■■■□ 3.09
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.31■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 HSPA2P54652 639 aa34.3■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3C2BO00750 1634 aa34.29■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.28■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
MEIS3-204ENST00000558555 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.26■■■■□ 3.07
MEIS3-204ENST00000558555 RGL3Q3MIN7 710 aa34.25■■■■□ 3.07
MEIS3-204ENST00000558555 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.25■■■■□ 3.07
MEIS3-204ENST00000558555 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MEIS3-204ENST00000558555 IDI1Q13907 227 aa34.19■■■■□ 3.06
MEIS3-204ENST00000558555 TNRQ92752 1358 aa34.19■■■■□ 3.06
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRB3O60242 1522 aa34.19■■■■□ 3.06
MEIS3-204ENST00000558555 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.17■■■■□ 3.06
MEIS3-204ENST00000558555 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.15■■■■□ 3.06
MEIS3-204ENST00000558555 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.13■■■■□ 3.05
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
MEIS3-204ENST00000558555 STAC3Q96MF2 364 aa34.09■■■■□ 3.05
MEIS3-204ENST00000558555 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.09■■■■□ 3.05
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.09■■■■□ 3.05
MEIS3-204ENST00000558555 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.07■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.05■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 NLRP1Q9C000 1473 aa34.05■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 IFT172Q9UG01 1749 aa34.04■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.02■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 PPLO60437 1756 aa34.01■■■■□ 3.04
MEIS3-204ENST00000558555 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
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