RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.95□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.94□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.94□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 PKD2Q13563 968 aa14.94□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 GGT6Q6P531 493 aa14.94□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 NEUROD1Q13562 356 aa14.92□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 ATP10AO60312 1499 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 UNC13BO14795 1591 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.9□□□□□ -0.02
SRP54-208ENST00000555557 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 KANK1Q14678 1352 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 DEPDC5O75140 1603 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 MLECQ14165 292 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRP54-208ENST00000555557 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 REREQ9P2R6 1566 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 AGLP35573 1532 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 PLA2R1Q13018 1463 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 ABCC3O15438 1527 aa14.77□□□□□ -0.04
SRP54-208ENST00000555557 CEP152O94986 1710 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 E9PCH4 1651 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 TET3O43151 1660 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 TONSLQ96HA7 1378 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 NPATQ14207 1427 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 PTPRTO14522 1441 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SRP54-208ENST00000555557 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 RGL3Q3MIN7 710 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 TRPM2O94759 1503 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 ZMYM3Q14202 1370 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 NOS1P29475 1434 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-208ENST00000555557 CLTCL1P53675 1640 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 IDI1Q13907 227 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 ERVK-7P63135 1459 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 SYNMO15061 1565 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-208ENST00000555557 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.56□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.56□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 MADDQ8WXG6 1647 aa14.55□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 PIK3C2BO00750 1634 aa14.55□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 TNRQ92752 1358 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 MROH2AA6NES4 1674 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 ADGRB3O60242 1522 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 KIF1BO60333 1816 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-208ENST00000555557 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 C3P01024 1663 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 STAC3Q96MF2 364 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-208ENST00000555557 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms