RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553878.5

CKB-205, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-205ENST00000553878 ERBINQ96RT1 1412 aa44.92■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.91■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.91■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 NCOA1Q15788 1441 aa44.89■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.89■■■■■ 4.78
CKB-205ENST00000553878 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.87■■■■■ 4.77
CKB-205ENST00000553878 ZMYM3Q14202 1370 aa44.86■■■■■ 4.77
CKB-205ENST00000553878 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
CKB-205ENST00000553878 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.84■■■■■ 4.77
CKB-205ENST00000553878 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
CKB-205ENST00000553878 NPATQ14207 1427 aa44.79■■■■■ 4.76
CKB-205ENST00000553878 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.78■■■■■ 4.76
CKB-205ENST00000553878 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.76■■■■■ 4.76
CKB-205ENST00000553878 PTPRKQ15262 1439 aa44.76■■■■■ 4.76
CKB-205ENST00000553878 DEPDC5O75140 1603 aa44.73■■■■■ 4.75
CKB-205ENST00000553878 ROCK1Q13464 1354 aa44.72■■■■■ 4.75
CKB-205ENST00000553878 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
CKB-205ENST00000553878 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.72■■■■■ 4.75
CKB-205ENST00000553878 ABCC3O15438 1527 aa44.7■■■■■ 4.75
CKB-205ENST00000553878 CEP152O94986 1710 aa44.65■■■■■ 4.74
CKB-205ENST00000553878 ITGAEP38570 1179 aa44.65■■■■■ 4.74
CKB-205ENST00000553878 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.65■■■■■ 4.74
CKB-205ENST00000553878 PZPP20742 1482 aa44.65■■■■■ 4.74
CKB-205ENST00000553878 KANK1Q14678 1352 aa44.59■■■■■ 4.73
CKB-205ENST00000553878 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.59■■■■■ 4.73
CKB-205ENST00000553878 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.56■■■■■ 4.72
CKB-205ENST00000553878 HSPA2P54652 639 aa44.53■■■■■ 4.72
CKB-205ENST00000553878 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.52■■■■■ 4.721e-7■□□□□ 8.2
CKB-205ENST00000553878 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
CKB-205ENST00000553878 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.51■■■■■ 4.72
CKB-205ENST00000553878 TNRQ92752 1358 aa44.46■■■■■ 4.71
CKB-205ENST00000553878 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.46■■■■■ 4.71
CKB-205ENST00000553878 UNC13BO14795 1591 aa44.44■■■■■ 4.71
CKB-205ENST00000553878 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
CKB-205ENST00000553878 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
CKB-205ENST00000553878 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.43■■■■■ 4.7
CKB-205ENST00000553878 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.41■■■■■ 4.7
CKB-205ENST00000553878 ERVK-7P63135 1459 aa44.39■■■■■ 4.7
CKB-205ENST00000553878 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
CKB-205ENST00000553878 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.37■■■■■ 4.69
CKB-205ENST00000553878 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.36■■■■■ 4.69
CKB-205ENST00000553878 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.34■■■■■ 4.69
CKB-205ENST00000553878 NLRP1Q9C000 1473 aa44.34■■■■■ 4.69
CKB-205ENST00000553878 TET3O43151 1660 aa44.3■■■■■ 4.68
CKB-205ENST00000553878 STRCQ7RTU9 1775 aa44.28■■■■■ 4.68
CKB-205ENST00000553878 NAIPQ13075 1403 aa44.27■■■■■ 4.68
CKB-205ENST00000553878 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.27■■■■■ 4.68
CKB-205ENST00000553878 HFM1A2PYH4 1435 aa44.24■■■■■ 4.67
CKB-205ENST00000553878 PLA2R1Q13018 1463 aa44.21■■■■■ 4.67
CKB-205ENST00000553878 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
CKB-205ENST00000553878 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.17■■■■■ 4.66
CKB-205ENST00000553878 NUP155O75694 1391 aa44.17■■■■■ 4.66
CKB-205ENST00000553878 DMRT2Q9Y5R5 561 aa44.16■■■■■ 4.66
CKB-205ENST00000553878 NOS1P29475 1434 aa44.1■■■■■ 4.65
CKB-205ENST00000553878 E9PCH4 1651 aa44.08■■■■■ 4.65
CKB-205ENST00000553878 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
CKB-205ENST00000553878 SYNMO15061 1565 aa44.07■■■■■ 4.65
CKB-205ENST00000553878 PTPRTO14522 1441 aa44.07■■■■■ 4.64
CKB-205ENST00000553878 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.05■■■■■ 4.64
CKB-205ENST00000553878 PKD2Q13563 968 aa44.05■■■■■ 4.64
CKB-205ENST00000553878 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
CKB-205ENST00000553878 PIK3C2BO00750 1634 aa44.01■■■■■ 4.64
CKB-205ENST00000553878 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
CKB-205ENST00000553878 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.98■■■■■ 4.63
CKB-205ENST00000553878 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.94■■■■■ 4.62
CKB-205ENST00000553878 IDI1Q13907 227 aa43.9■■■■■ 4.62
CKB-205ENST00000553878 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.9■■■■■ 4.62
CKB-205ENST00000553878 TRIM52Q96A61 297 aa43.89■■■■■ 4.62
CKB-205ENST00000553878 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.88■■■■■ 4.62
CKB-205ENST00000553878 ADGRB3O60242 1522 aa43.88■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.88■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.86■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 SLIT1O75093 1534 aa43.85■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.83■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
CKB-205ENST00000553878 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.81■■■■■ 4.6
CKB-205ENST00000553878 MED14O60244 1454 aa43.79■■■■■ 4.6
CKB-205ENST00000553878 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
CKB-205ENST00000553878 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.75■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 IQGAP1P46940 1657 aa43.75■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.73■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.73■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 EID1Q9Y6B2 187 aa43.71■■■■■ 4.59
CKB-205ENST00000553878 TRPM2O94759 1503 aa43.68■■■■■ 4.58
CKB-205ENST00000553878 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.66■■■■■ 4.58
CKB-205ENST00000553878 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.64■■■■■ 4.58
CKB-205ENST00000553878 LTKP29376 864 aa43.61■■■■■ 4.57
CKB-205ENST00000553878 LTBP4Q8N2S1 1624 aa43.61■■■■■ 4.57
CKB-205ENST00000553878 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
CKB-205ENST00000553878 CLTCL1P53675 1640 aa43.58■■■■■ 4.57
CKB-205ENST00000553878 CERKQ8TCT0 537 aa43.57■■■■■ 4.57
CKB-205ENST00000553878 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
CKB-205ENST00000553878 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.54■■■■■ 4.56
CKB-205ENST00000553878 ZFYVE9O95405 1425 aa43.54■■■■■ 4.56
CKB-205ENST00000553878 KIF1BO60333 1816 aa43.53■■■■■ 4.56
CKB-205ENST00000553878 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms