RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CS-231ENST00000552222 TNRQ92752 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-231ENST00000552222 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-231ENST00000552222 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-231ENST00000552222 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.45■■□□□ 1.19
CS-231ENST00000552222 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 KIF3BO15066 747 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 POTEAQ6S8J7 498 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-231ENST00000552222 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 MBD5Q9P267 1494 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 PZPP20742 1482 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 MIA2Q96PC5 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 MED14O60244 1454 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-231ENST00000552222 IQGAP1P46940 1657 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 TIAM1Q13009 1591 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 DEPDC5O75140 1603 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-231ENST00000552222 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 NLRP1Q9C000 1473 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 LTKP29376 864 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-231ENST00000552222 SYNMO15061 1565 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 NCOA2Q15596 1464 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 ABCC3O15438 1527 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 ERVK-7P63135 1459 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-231ENST00000552222 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 TMEM94Q12767 1356 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 CEP162Q5TB80 1403 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-231ENST00000552222 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 CEP152O94986 1710 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 MAP3K1Q13233 1512 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 TSPY4P0CV99 314 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 TSPY10P0CW01 314 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 TRIM52Q96A61 297 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-231ENST00000552222 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 SLIT1O75093 1534 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 EID1Q9Y6B2 187 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 PIK3C2BO00750 1634 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 LRP6O75581 1613 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 KCNA6P17658 529 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-231ENST00000552222 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.16e-9■□□□□ 10
CS-231ENST00000552222 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 PHLPP1O60346 1717 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 SLAIN2Q9P270 581 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 IDI1Q13907 227 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 JCADQ9P266 1359 aa21.89■■□□□ 1.1
CS-231ENST00000552222 TET3O43151 1660 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.87■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 BCANQ96GW7 911 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 MSH6P52701 1360 aa21.84■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-231ENST00000552222 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 NWD1Q149M9 1564 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 KIF15Q9NS87 1388 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 RXRBP28702 533 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CS-231ENST00000552222 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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