RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544213.5

PUS1-210, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-210ENST00000544213 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.96■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 C3P01024 1663 aa36.95■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PUS1-210ENST00000544213 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PUS1-210ENST00000544213 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PUS1-210ENST00000544213 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.9■■■■□ 3.5
PUS1-210ENST00000544213 ZMYM3Q14202 1370 aa36.9■■■■□ 3.5
PUS1-210ENST00000544213 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.89■■■■□ 3.5
PUS1-210ENST00000544213 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
PUS1-210ENST00000544213 ROCK1Q13464 1354 aa36.88■■■■□ 3.49
PUS1-210ENST00000544213 PTPRKQ15262 1439 aa36.85■■■■□ 3.49
PUS1-210ENST00000544213 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.85■■■■□ 3.49
PUS1-210ENST00000544213 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
PUS1-210ENST00000544213 NPATQ14207 1427 aa36.81■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.8■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 DEPDC5O75140 1603 aa36.78■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.78■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.77■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.76■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 ITGAEP38570 1179 aa36.76■■■■□ 3.48
PUS1-210ENST00000544213 ABCC3O15438 1527 aa36.73■■■■□ 3.47
PUS1-210ENST00000544213 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.71■■■■□ 3.47
PUS1-210ENST00000544213 KANK1Q14678 1352 aa36.71■■■■□ 3.47
PUS1-210ENST00000544213 PZPP20742 1482 aa36.69■■■■□ 3.46
PUS1-210ENST00000544213 CEP152O94986 1710 aa36.66■■■■□ 3.46
PUS1-210ENST00000544213 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.63■■■■□ 3.45
PUS1-210ENST00000544213 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.451e-6■■□□□ 12
PUS1-210ENST00000544213 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.61■■■■□ 3.45
PUS1-210ENST00000544213 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.59■■■■□ 3.45
PUS1-210ENST00000544213 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.58■■■■□ 3.45
PUS1-210ENST00000544213 UNC13BO14795 1591 aa36.56■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.56■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 TNRQ92752 1358 aa36.53■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.51■■■■□ 3.44
PUS1-210ENST00000544213 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.5■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 HSPA2P54652 639 aa36.5■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 HFM1A2PYH4 1435 aa36.48■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 NAIPQ13075 1403 aa36.47■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 ERVK-7P63135 1459 aa36.47■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 NLRP1Q9C000 1473 aa36.45■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
PUS1-210ENST00000544213 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.44■■■■□ 3.42
PUS1-210ENST00000544213 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.44■■■■□ 3.42
PUS1-210ENST00000544213 TET3O43151 1660 aa36.43■■■■□ 3.42
PUS1-210ENST00000544213 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.41■■■■□ 3.42
PUS1-210ENST00000544213 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
PUS1-210ENST00000544213 NUP155O75694 1391 aa36.38■■■■□ 3.41
PUS1-210ENST00000544213 PLA2R1Q13018 1463 aa36.32■■■■□ 3.41
PUS1-210ENST00000544213 STRCQ7RTU9 1775 aa36.31■■■■□ 3.4
PUS1-210ENST00000544213 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.31■■■■□ 3.4
PUS1-210ENST00000544213 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.29■■■■□ 3.4
PUS1-210ENST00000544213 NOS1P29475 1434 aa36.28■■■■□ 3.4
PUS1-210ENST00000544213 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
PUS1-210ENST00000544213 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
PUS1-210ENST00000544213 E9PCH4 1651 aa36.25■■■■□ 3.39
PUS1-210ENST00000544213 PKD2Q13563 968 aa36.23■■■■□ 3.39
PUS1-210ENST00000544213 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.21■■■■□ 3.39
PUS1-210ENST00000544213 SYNMO15061 1565 aa36.2■■■■□ 3.39
PUS1-210ENST00000544213 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 PTPRTO14522 1441 aa36.18■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.18■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 TRIM52Q96A61 297 aa36.16■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 PIK3C2BO00750 1634 aa36.15■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.14■■■■□ 3.38
PUS1-210ENST00000544213 IDI1Q13907 227 aa36.13■■■■□ 3.37
PUS1-210ENST00000544213 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
PUS1-210ENST00000544213 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.11■■■■□ 3.37
PUS1-210ENST00000544213 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.11■■■■□ 3.37
PUS1-210ENST00000544213 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.09■■■■□ 3.37
PUS1-210ENST00000544213 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.05■■■■□ 3.36
PUS1-210ENST00000544213 ADGRB3O60242 1522 aa36.05■■■■□ 3.36
PUS1-210ENST00000544213 SLIT1O75093 1534 aa36.04■■■■□ 3.36
PUS1-210ENST00000544213 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PUS1-210ENST00000544213 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.02■■■■□ 3.36
PUS1-210ENST00000544213 MED14O60244 1454 aa35.99■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.99■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.99■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 EID1Q9Y6B2 187 aa35.97■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.97■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 HRCP23327 699 aa35.95■■■■□ 3.35
PUS1-210ENST00000544213 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.94■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 TRPM2O94759 1503 aa35.94■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.91■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.91■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 IQGAP1P46940 1657 aa35.91■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.9■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PUS1-210ENST00000544213 LTKP29376 864 aa35.86■■■■□ 3.33
PUS1-210ENST00000544213 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PUS1-210ENST00000544213 CLTCL1P53675 1640 aa35.83■■■■□ 3.33
PUS1-210ENST00000544213 KIF1BO60333 1816 aa35.81■■■■□ 3.32
PUS1-210ENST00000544213 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
PUS1-210ENST00000544213 ZFYVE9O95405 1425 aa35.8■■■■□ 3.32
PUS1-210ENST00000544213 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms