RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537739.5

HDGF-210, Transcript of heparin binding growth factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGF, Length 2,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGF-210ENST00000537739 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.36■■■■□ 3.41
HDGF-210ENST00000537739 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.35■■■■□ 3.41
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HDGF-210ENST00000537739 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.31■■■■□ 3.4
HDGF-210ENST00000537739 ANP32CO43423 234 aa36.31■■■■□ 3.4
HDGF-210ENST00000537739 CCDC7Q96M83 1385 aa36.28■■■■□ 3.4
HDGF-210ENST00000537739 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.28■■■■□ 3.4
HDGF-210ENST00000537739 ATP10AO60312 1499 aa36.26■■■■□ 3.39
HDGF-210ENST00000537739 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.25■■■■□ 3.39
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HDGF-210ENST00000537739 E9PCH4 1651 aa36.2■■■■□ 3.39
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HDGF-210ENST00000537739 A2MP01023 1474 aa36.16■■■■□ 3.38
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HDGF-210ENST00000537739 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
HDGF-210ENST00000537739 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.14■■■■□ 3.38
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HDGF-210ENST00000537739 NEO1Q92859 1461 aa36.04■■■■□ 3.36
HDGF-210ENST00000537739 RAPGEF3O95398 923 aa36.03■■■■□ 3.36
HDGF-210ENST00000537739 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.03■■■■□ 3.36
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HDGF-210ENST00000537739 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.98■■■■□ 3.35
HDGF-210ENST00000537739 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.98■■■■□ 3.35
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HDGF-210ENST00000537739 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.93■■■■□ 3.34
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HDGF-210ENST00000537739 LAMC1P11047 1609 aa35.79■■■■□ 3.32
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HDGF-210ENST00000537739 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.78■■■■□ 3.32
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HDGF-210ENST00000537739 MRS2Q9HD23 443 aa35.6■■■■□ 3.29
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HDGF-210ENST00000537739 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
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HDGF-210ENST00000537739 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.54■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.54■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 MYOM2P54296 1465 aa35.53■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 ADGRB3O60242 1522 aa35.53■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 IFT172Q9UG01 1749 aa35.53■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.52■■■■□ 3.28
HDGF-210ENST00000537739 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.5■■■■□ 3.27
HDGF-210ENST00000537739 NOS1P29475 1434 aa35.5■■■■□ 3.27
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