RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531289.5

RAB2A-211, Transcript of RAB2A, member RAS oncogene family, human

TSL 2 BASIC

Gene RAB2A, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB2A-211	ENST00000531289	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.32	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.31	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.28	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.27	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.27	■■■□□ 2.28
RAB2A-211	ENST00000531289	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.26	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.24	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	PZP	P20742	1482 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.2	■■■□□ 2.27
RAB2A-211	ENST00000531289	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.19	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	ABCC3	O15438	1527 aa		29.19	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.17	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
RAB2A-211	ENST00000531289	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	TNR	Q92752	1358 aa		29.12	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.12	■■■□□ 2.25	1e-7	■■□□□ 13.4
RAB2A-211	ENST00000531289	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.1	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.1	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RAB2A-211	ENST00000531289	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	KANK1	Q14678	1352 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	CEP152	O94986	1710 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	PTPRT	O14522	1441 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
RAB2A-211	ENST00000531289	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RAB2A-211	ENST00000531289	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
RAB2A-211	ENST00000531289	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29	■■■□□ 2.23
RAB2A-211	ENST00000531289	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RAB2A-211	ENST00000531289	PKD2	Q13563	968 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RAB2A-211	ENST00000531289	ITGAE	P38570	1179 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RAB2A-211	ENST00000531289	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RAB2A-211	ENST00000531289	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RAB2A-211	ENST00000531289	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RAB2A-211	ENST00000531289	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAB2A-211	ENST00000531289	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAB2A-211	ENST00000531289	UNC13B	O14795	1591 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RAB2A-211	ENST00000531289	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	TET3	O43151	1660 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	NOS1	P29475	1434 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RAB2A-211	ENST00000531289	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	SYNM	O15061	1565 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	NUP155	O75694	1391 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	MED14	O60244	1454 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	NAIP	Q13075	1403 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RAB2A-211	ENST00000531289	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	SLIT1	O75093	1534 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	IDI1	Q13907	227 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
RAB2A-211	ENST00000531289	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289		E9PCH4	1651 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.64	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	LTK	P29376	864 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RAB2A-211	ENST00000531289	CPS1	P31327	1500 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RAB2A-211	ENST00000531289	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RAB2A-211	ENST00000531289	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RAB2A-211	ENST00000531289	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RAB2A-211	ENST00000531289	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	TRPM2	O94759	1503 aa		28.39	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.39	■■■□□ 2.14
RAB2A-211	ENST00000531289	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.38	■■■□□ 2.13

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms